员工旷工三天以上并不直接等同于自动解除劳动关系，是否构成自动解除劳动关系需根据用人单位的规章制度及法律规定来判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律法规层面

1. 无统一规定：我国《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》中，并未直接规定旷工多少天即构成自动离职或自动解除劳动关系。因此，不能仅凭旷工三天就直接认定劳动关系自动解除。

2. 劳动合同解除条件：根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位有权解除劳动合同。但“严重违反”的具体标准需由用人单位的规章制度来界定。

3. 自动离职的法律定义缺失：法律上并未对“自动离职”给出统一、明确的定义。通常理解为劳动者不告而别、擅自离开工作岗位的行为，但这并不等同于劳动关系自动解除。劳动关系的解除需遵循法定程序或双方协商一致。

二、用人单位规章制度层面

1. 规章制度的制定与效力：

   • 用人单位有权制定规章制度，但这些制度必须符合法律规定，经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等），并向劳动者公示或告知。
   • 合法有效的规章制度可以作为确定双方权利义务的依据。

2. 旷工规定的设定：

   • 若用人单位在规章制度中明确规定旷工三天属于严重违反规章制度的行为，且该规定合法有效，则用人单位可依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以劳动者严重违反规章制度为由解除劳动合同。
   • 若规章制度无此规定或规定不合法（如未经民主程序制定、未向劳动者公示等），则用人单位不能仅凭旷工三天就认定劳动关系自动解除。

三、实际操作建议

1. 沟通与了解：面对劳动者旷工的情况，用人单位应首先与劳动者沟通，了解其旷工的原因，并尝试解决问题。这有助于维护和谐的劳动关系，避免不必要的法律纠纷。

2. 依法处理：若劳动者确实存在严重违反公司规章制度的行为，且公司规章制度有明确规定，用人单位应依法单方面解除劳动合同，并确保支付劳动者正常工作时间期间的工资。同时，无需支付经济补偿金。但需注意，解除劳动合同的决定应书面通知劳动者，并保留相关证据。

3. 完善规章制度：用人单位应不断完善自身的规章制度，确保规定的合法性、合理性和可操作性。规章制度应明确旷工等违纪行为的处理方式和程序，以便在处理类似问题时能够有据可依。

四、可能产生的法律后果

1. 若用人单位规章制度合法有效且明确规定旷工三天为严重违纪行为：用人单位可依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿金。但需注意，解除劳动合同的决定应合法合规，避免侵犯劳动者的合法权益。

2. 若用人单位规章制度无此规定或规定不合法：用人单位不能仅凭旷工三天就解除劳动合同。若用人单位违法解除劳动合同，劳动者有权要求用人单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。

总结与建议：员工旷工三天以上并不直接等同于自动解除劳动关系。是否构成自动解除劳动关系需根据用人单位的规章制度及法律规定来判断。对于劳动者而言，应了解并遵守用人单位的规章制度和劳动合同约定；对于用人单位而言，在制定规章制度时应确保内容的合法性和有效性，并在解除劳动合同时充分考虑实际情况的合理性。在发生争议时，双方可寻求法律援助或通过司法途径解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。