结论：承包期内第一次承包到期后，合同期超过部分是否有效，需根据具体情况判断，主要取决于合同双方是否有续约的意思表示、原合同条款的约定以及是否违反法律法规的强制性规定。以下从不同角度进行分析：
合同双方有续约意思表示且原合同无相反约定：
- 若在第一次承包期到期前或到期时，合同双方均表达了续约的意愿，并且原合同中并未明确禁止或限制续约，同时续约的内容（包括承包期限、承包费用等）也符合法律法规的规定，那么合同期超过部分（即续约部分）通常是有效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为是民事主体通过意思表示设立、变更、终止民事法律关系的行为。合同双方有续约的意思表示，且该意思表示真实、合法、有效，不违反法律法规的强制性规定，因此续约部分有效。
合同双方无续约意思表示或原合同有相反约定：
- 若在第一次承包期到期时，合同双方并未表达续约的意愿，或者原合同中明确规定了承包期到期后合同自动终止，不得续约，那么合同期超过部分（即未经双方同意擅自延续的部分）通常是无效的。
- 法律依据：同样根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同应当遵循公平原则确定各方的权利和义务，并不得违反法律法规的强制性规定。若合同双方无续约意思表示或原合同有相反约定，则擅自延续合同期限的行为违反了合同的公平原则和原合同的约定，因此无效。
合同期超过部分违反法律法规的强制性规定：
- 无论合同双方是否有续约的意思表示，如果合同期超过部分的内容违反了法律法规的强制性规定（如超过了法律规定的最高承包期限、违反了土地管理法等相关法律法规的规定），那么该部分合同内容也是无效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条的规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，如果合同期超过部分违反了法律法规的强制性规定，则该部分无效。
建议：
- 在处理此类问题时，建议首先查阅原合同的具体条款，了解双方对承包期限、续约等事项的约定。
- 如果合同中有续约条款或双方有续约的意愿，建议及时签订书面的续约协议，明确续约的期限、条件等事项。
- 如果合同期超过部分存在争议或违反了法律法规的强制性规定，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
后续行动：
- 如果您在处理此类问题时遇到任何法律难题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。