开发公司延期违约金的计算方式主要取决于合同约定和法律规定，具体分以下两种情况说明：

1. 合同有明确约定
   若购房合同或开发协议中明确约定了延期交付的违约金计算方式（如按日支付已付房款万分之X，或固定金额），则直接按合同执行。
   示例：合同约定“逾期超过90日，按日支付已付房款万分之一的违约金”，若已付房款为200万元，逾期60天，则违约金=200万×0.01%×60=1.2万元。
   注意：若违约金过高或过低，法院可能根据实际损失调整（如租金损失、资金占用成本等）。

2. 合同未约定或约定不明
   根据《民法典》第五百八十四条，违约方需赔偿守约方实际损失，包括：

   • 直接损失：如租房费用、临时住宿费等；
     
   • 间接损失：如因延期导致错过入学、结婚等特殊需求的合理支出。
     示例：若购房者因延期交付需额外支付3个月租金（每月5000元），则开发商需赔偿1.5万元。
     提示：需保留相关证据（如租房合同、付款凭证等），否则可能影响赔偿主张。

特殊情形：

• 若开发商主张因不可抗力（如自然灾害、政策调整）延期，需提供政府文件、施工日志等证据，否则仍需承担违约责任。
  
• 若购房者选择解除合同，可同时主张违约金和实际损失赔偿（但总额不得超过实际损失的30%）。

建议：

1. 优先核对合同条款，明确违约金计算基数（如已付房款、总房款）和比例；
   
2. 收集实际损失证据（如租金发票、交通费票据等）；
   
3. 若与开发商协商无果，可向当地房管部门投诉或直接起诉至法院。
   

如有具体合同条款或损失明细，可进一步向我咨询，我会帮您详细分析计算方式。