协商还款后，按照协商金额归还完毕，可按以下步骤开具结清证明：
主动联系债权人：首先，您需要主动联系与您协商还款的债权人（如银行、贷款公司、个人等），明确告知对方您已按照协商的金额和期限完成了全部还款。
提出开具结清证明的请求：在确认还款无误后，向债权人提出开具结清证明的正式请求。结清证明是证明您已履行完毕还款义务的重要法律文件，对于您后续处理与该债务相关的事宜（如信用修复、贷款申请等）具有关键作用。
确认结清证明的内容：在债权人同意开具结清证明后，您应与对方确认证明的具体内容，包括但不限于：您的姓名、身份证号码、债务类型、债务金额、还款期限、还款金额、结清日期等。确保所有信息准确无误，以免后续产生纠纷。
选择结清证明的形式：结清证明可以以书面形式出具，也可以电子形式（如电子邮件、短信等）发送。您应与债权人协商确定最合适的证明形式，并确保其具有法律效力。如果可能的话，尽量选择书面形式，并加盖债权人的公章或签字确认，以增加证明的可信度。
接收并保存结清证明：在债权人出具结清证明后，您应及时接收并妥善保存。如果是书面形式，建议将其存放在安全的地方，并备份电子版；如果是电子形式，建议打印出来并签字确认，同时保存好电子文件。
后续跟进与确认：在收到结清证明后，您还可以与债权人进行后续跟进，确认对方是否已更新其内部系统中的您的还款状态，以确保您的信用记录不受影响。
特殊情况处理：
如果债权人拒绝开具结清证明：您应首先与债权人沟通，了解其拒绝的原因。如果是因为您未完全履行还款义务，您应尽快补足差额；如果是因为其他原因，您可以考虑通过法律途径解决，如向消费者权益保护机构投诉或提起诉讼。
如果结清证明内容有误：您应及时与债权人联系，要求其更正错误内容，并重新出具正确的结清证明。
温馨提示：在协商还款和开具结清证明的过程中，建议您保留好所有相关的沟通记录和文件，以备不时之需。如果您在处理过程中遇到任何法律问题或困惑，欢迎随时向我咨询。