当运货司机将货物掉包时，您可以按照以下步骤来处理，以有效维护自己的权益并确保获得应有的赔偿：
一、明确法律责任
首先，要明确的是，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，承运人（在此情况下即运货司机或其所属的运输公司）对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任。因此，当货物被掉包时，承运人应依法承担相应的赔偿责任。
二、保留关键证据
为了支持您的索赔请求，您需要保留以下关键证据：
- 运输单据：包括运单、发货凭证等，这些单据记录了运输的基本信息，是证明运输服务合同关系及货物信息的重要依据。
- 货物信息：收集能证明所运货物价值、特征的证据，如购买发票、商品官网截图、照片或视频等。对于贵重物品，可能还需要提供鉴定或评估报告。
- 沟通记录：保留与运货司机、运输公司客服或相关人员的通话录音、聊天记录等，以证明您已及时发现问题并尝试解决。
三、及时联系运输公司并报案
- 尽快反馈：一旦发现货物被掉包，应立即联系运输公司，详细说明情况并提出索赔要求。您可以通过运输公司的官方客服电话、当地网点或在线客服平台进行反馈。
- 配合调查：按照运输公司的要求提供相关证据和信息，协助其调查货物的运输、中转、派送情况，以尽快查明原因并确定责任方。
四、索赔与赔偿
- 保价货物：如果您在运输时选择了保价服务，那么赔偿金额将按照保价额来确定。如果货物全部损毁或丢失，将按保价额全额赔偿；如果部分损毁或内件短少，则按比例计算赔偿。
- 未保价货物：对于未选择保价服务的货物，赔偿金额将按实际损失来确定。但需要注意的是，最高赔偿额通常不超过所收取资费的三倍，具体限额可能因运输公司而异。
- 协商赔偿：在与运输公司协商赔偿事宜时，要明确提出您的赔偿要求和依据，并尽量达成一致意见。双方可以签订赔偿协议以明确各自的权利和义务。
五、投诉与申诉
- 向运输公司客服投诉：如果您对运输公司的处理结果不满意，可以再次向其客服部门投诉，并要求更高层级的管理人员介入处理。
- 行业监管部门投诉：如果运输公司未能积极处理或处理结果仍不能令您满意，您可以向相关的行业监管部门进行投诉。例如，您可以拨打邮政业消费者申诉专用电话“12305”或访问国家邮政局申诉网站进行投诉。
六、考虑法律途径
- 报警：如果掉包的货物价值较高或涉及刑事犯罪（如盗窃、诈骗等），您应立即向公安机关报案，并配合其进行调查。
- 提起民事诉讼：如果与运输公司无法通过协商解决赔偿问题，您可以考虑向人民法院提起民事诉讼。在提起诉讼前，请确保您已准备充分的证据材料来支持您的诉讼请求。
七、预防措施
为了避免类似情况再次发生，建议您采取以下预防措施：
- 选择信誉良好的运输公司进行合作。
- 在填写运输单据时，详细标明货物的价值、特征等信息。
- 对贵重物品进行保价，以增加赔偿的保障。
- 在收货时，先验货后签收，确保收到的货物与寄送时一致。
综上所述，当运货司机将货物掉包时，您应首先保留关键证据，及时联系运输公司并报案，然后根据是否保价选择相应的赔偿方式。如果无法协商解决，您可以通过投诉、申诉或法律途径来维护自己的权益。同时，采取预防措施可以降低类似风险的发生概率。