未经著作权人同意发行其作品，违法所得的计算主要依据实际销售金额减去成本后的净收益，但具体计算方式和标准需结合案件具体情况及司法解释来确定。以下从不同角度为您详细分析：

一、违法所得的基本计算原则

在侵犯著作权案件中，违法所得通常指的是侵权人通过实施侵权行为所获得的净收益。这一般是指实际销售金额减去成本（包括制作成本、运输成本、销售成本等）后的金额。然而，在实际操作中，由于成本计算可能涉及多个方面且存在争议，因此司法实践中往往更倾向于直接以销售金额作为违法所得的计算基础，特别是在难以准确核算成本的情况下。

二、司法解释中的具体标准

根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》的相关规定，对于侵犯著作权罪，违法所得数额在三万元以上的，属于“违法所得数额较大”；违法所得数额在十五万元以上的，则属于“违法所得数额巨大”。这些标准为司法机关在量刑时提供了明确的依据。

具体计算公式（示例）：

• 若实际销售金额为X元，成本为Y元，则违法所得净收益为（X-Y）元。
• 在司法实践中，若成本难以准确核算，可能直接以销售金额X元作为违法所得的计算基础。

三、不同情形下的违法所得计算

1. 直接销售侵权复制品：

   • 在这种情况下，违法所得通常就是销售侵权复制品所获得的全部收入，减去可能的直接成本（如制作、运输等费用，但若这些费用已包含在销售价格中且难以单独核算，则可能直接以销售金额计算）。

2. 通过信息网络传播侵权作品：

   • 若侵权人通过广告、会员费等方式获得收益，则这些收益均应计入违法所得。
   • 若侵权作品是免费提供的，但侵权人通过其他方式（如捆绑销售、植入广告等）获得收益，这些收益也应计入违法所得。

3. 多次侵权或涉及多个作品：

   • 在这种情况下，违法所得应累计计算，即将每次侵权行为所获得的违法所得相加。

四、法律后果与量刑标准

根据《中华人民共和国刑法》第二百一十七条的规定，以营利为目的，未经著作权人许可复制发行其作品，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。因此，违法所得的计算不仅关系到侵权人是否构成犯罪，还直接影响到其可能面临的刑罚轻重。

五、实际案例与启示

在实际案例中，违法所得的计算往往涉及复杂的证据收集和核算过程。例如，在一起侵犯著作权案件中，侵权人通过多个渠道销售侵权复制品，且销售记录分散、不完整。在这种情况下，司法机关可能需要通过审计、鉴定等方式来准确核算违法所得。这提醒我们，在侵犯著作权案件中，保留完整的销售记录和财务凭证至关重要，以便在发生纠纷时能够准确计算违法所得并维护自己的合法权益。

总结与建议：

未经著作权人同意发行其作品是严重的侵权行为，不仅可能面临民事赔偿和行政处罚，还可能构成犯罪并受到刑事处罚。在计算违法所得时，应综合考虑实际销售金额、成本以及司法解释中的具体标准。若您或您身边的人涉及此类问题，建议及时向我咨询，以便根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。