版权局会对公司使用盗版软件的行为进行管理。以下从不同角度为您详细分析：

一、版权局的职责与权力

版权局作为负责著作权管理工作的政府部门，其职责之一就是监督和查处侵犯著作权的行为，这自然包括了对公司使用盗版软件行为的监督和管理。当版权局发现或接到举报公司存在使用盗版软件的情况时，有权进行调查，并根据调查结果采取相应的行政措施。

二、公司使用盗版软件的法律后果

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国著作权法》及相关规定，公司未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，属于侵权行为。对于使用盗版软件的行为，版权局可以责令停止侵权行为，没收违法所得，没收、销毁侵权复制品，并可处以罚款。
   • 罚款的数额通常根据侵权行为的情节严重程度、违法所得数额以及造成的损失等因素来确定。

2. 民事赔偿：

   • 除了行政处罚外，公司还可能面临著作权人的民事赔偿诉讼。著作权人有权要求侵权公司赔偿因其侵权行为所造成的损失，包括直接损失和间接损失。

3. 刑事责任：

   • 在某些情况下，如果公司使用盗版软件的行为情节特别严重，如违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的，还可能构成犯罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵犯著作权罪可处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金；情节特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

三、版权局管理公司使用盗版软件的方式

1. 主动巡查：版权局可能会定期或不定期地对市场上的软件使用情况进行巡查，以发现潜在的侵权行为。

2. 接受举报：版权局也接受来自社会各界的举报，对于举报的公司使用盗版软件的行为，版权局会进行调查核实。

3. 合作执法：版权局还可能与其他相关部门（如市场监管部门、公安部门等）进行合作，共同打击侵犯著作权的行为。

四、建议与措施

1. 加强内部管理：公司应建立健全的软件使用管理制度，确保所有使用的软件都是合法授权的。

2. 定期自查：公司应定期对自身的软件使用情况进行自查，及时发现并纠正潜在的侵权行为。

3. 积极配合调查：如果公司接到版权局的调查通知，应积极配合调查工作，如实提供相关情况。

4. 寻求法律帮助：如果公司对软件使用方面的法律问题存在疑问或困惑，可以寻求专业律师的法律帮助，以确保自身的合法权益得到保障。

作为专注于知识产权、专利权领域的律师，我建议您公司务必严格遵守著作权法律法规，避免使用盗版软件。如果您或您的公司在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。