论文著作权转让协议的签字方式并非必须严格限定为手写。实际上，根据相关法律法规和实际操作情况，签字方式具有多样性，并且关键在于确保合同内容的真实性、合法性以及双方真实意愿的表达。

首先，我们来看手写签字。手写签字作为一种传统且直观的方式，具有个性化特征，易于通过笔迹鉴定来确认签字人的身份和真实意愿，从而增加了签名的真实性和可靠性。在签署重要协议时，很多人倾向于选择手写签字，以体现其正式性和严肃性。

然而，随着信息技术的发展，电子签名也逐渐被广泛接受并具备了法律效力。根据《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国电子签名法》等相关法律规定，可靠的电子签名与手写签名或盖章具有同等的法律效力。这意味着，在符合法律规定条件的情况下，电子签名同样可以作为有效的签字方式。使用电子签名时，需要确保其满足法律规定的条件，如电子签名制作数据的专有性、控制性、不可改动性等，以确保其法律效力和安全性。

除了签字方式外，合同签订的有效性还取决于其他多个要素。例如，合同内容必须真实、合法，并经双方当事人签字或盖章确认。为确保合同的有效性和保护双方权益，建议采取书面形式签订论文著作权转让协议，并详细列明转让的著作权内容、范围、期限、地域以及转让价格等关键信息。此外，双方在签订合同前应互相核实身份，确保对方具备签署合同的资格和权利。如有条件，还可以邀请第三方见证或到公证处进行公证，以增加合同的公信力和执行力。

综上所述，论文著作权转让协议的签字方式并非固定为手写，而是可以根据实际情况选择包括电子签名在内的其他合法方式。关键在于确保合同内容的真实性、合法性和双方的真实意愿表达，并采取必要的措施增强合同的法律效力和公信力。如果您在签订论文著作权转让协议过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请咨询专业的法律人士或机构。