针对您提出的“公司专利被非法转移”的问题，这是一个涉及知识产权保护和法律维权的重要事项。以下是我为您提供的详细解答和处理步骤：
一、问题确认与证据固定
确认非法转移事实：
- 首先，您需要确认专利确实被非法转移，这通常通过查询专利登记簿或专利管理部门的官方记录来确认。
固定证据：
- 收集所有与非法转移相关的证据，包括但不限于：转让合同（如果存在）、支付凭证（显示资金流向）、通信记录（如邮件、短信等证明非法行为的证据）、以及任何能证明您公司是专利原始权利人的文件。
- 特别注意保存任何可能显示盗用或冒用公司公章、签名等非法手段的证据。
二、向专利管理部门投诉
准备投诉材料：
- 撰写一份详细的投诉信，说明非法转移的情况、提供已固定的证据，并明确要求专利管理部门进行调查。
提交投诉：
- 将投诉信及相关证据提交给当地或国家级的专利管理部门（如国家知识产权局）。
- 专利管理部门会依据相关法律法规进行调查核实，这可能需要一段时间。
三、法律途径维权
行政处罚：
- 若经调查确认存在非法转让行为，专利管理部门将责令转让双方停止违法行为，并可能对转让方处以罚款等行政处罚。
民事诉讼：
- 同时，您作为受损的权利人，可以通过法律途径寻求更全面的救济。
- 向人民法院提起诉讼，要求确认转让无效，恢复您公司对专利的所有权。
- 还可以要求转让方返还因非法转让所获得的任何利益，并赔偿因非法转让给您公司造成的损失。
四、严惩犯罪分子
报警处理：
- 如果非法转移行为涉及盗用、冒用公司公章、签名等犯罪手段，您应立即向公安机关报案。
- 公安机关将展开刑事调查，追究犯罪分子的刑事责任。
配合调查：
- 在刑事调查过程中，积极配合公安机关提供证据和信息，协助查明事实真相。
五、后续预防措施
加强内部管理：
- 审查并加强公司内部对专利等知识产权的管理流程，确保类似事件不再发生。
- 定期对专利等知识产权进行审计和检查。
提高法律意识：
- 对公司员工进行知识产权保护的法律培训，提高大家的法律意识和防范能力。
六、法律依据
- 在处理专利非法转移问题时，需严格依据《专利法》等相关法律法规，以维护专利秩序和权利人的合法权益。
综上所述，面对公司专利被非法转移的情况，您应首先确认事实并固定证据，然后向专利管理部门投诉并寻求法律途径维权。同时，对于涉及犯罪的行为，应立即向公安机关报案。希望这些建议能对您有所帮助。