侵犯注册商标罪的判决确实会涉及对权利人的赔偿。以下从多个角度详细分析这一问题：
赔偿的法律依据：
- 根据《中华人民共和国商标法》第六十三条，侵犯商标专用权的赔偿数额，首先按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定。这意味着，如果权利人能够证明其因侵权行为遭受了具体的经济损失，那么这部分损失将作为赔偿的依据。
- 如果实际损失难以确定，赔偿数额可以按照侵权人因侵权所获得的利益来确定。这种方式下，侵权人的非法获利将被视为权利人的损失，并据此进行赔偿。
- 当权利人的损失和侵权人获得的利益都难以确定时，赔偿数额将参照该商标许可使用费的倍数来合理确定。这适用于权利人和侵权人之间的损失或获利难以计算的情况。
- 对于恶意侵犯商标专用权且情节严重的，法律还规定了惩罚性赔偿，即可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。这是对恶意侵权行为的严厉打击。
赔偿的具体内容：
- 赔偿数额不仅包括权利人因被侵权所受到的实际损失或侵权人因侵权所获得的利益，还包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支，如调查取证费用、律师费用等。这些费用是权利人为了维护自身权益而必须承担的，因此也应由侵权人承担。
- 如果权利人因被侵权所受到的实际损失、侵权人因侵权所获得的利益、注册商标许可使用费都难以确定，那么由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五百万元以下的赔偿。这是商标法对赔偿数额的上限规定，确保了赔偿的合理性和公正性。
刑事判决与民事赔偿的关系：
- 在侵犯注册商标罪的刑事案件中，除了对侵权人进行刑事处罚（如有期徒刑、罚金等）外，还会涉及民事赔偿问题。这是因为刑事处罚主要关注的是对侵权行为的惩罚和预防，而民事赔偿则更注重于弥补权利人因侵权行为所遭受的损失。
- 刑事判决中的民事赔偿部分，通常会在刑事判决书中明确列出赔偿金额和支付方式等，以确保权利人能够及时获得赔偿。
实际操作中的建议：
- 对于权利人来说，在发现自己的注册商标被侵权时，应及时收集证据并寻求法律帮助。这包括保存与侵权行为相关的证据（如侵权产品、销售记录等）、咨询专业律师以了解自己的权益和维权途径等。
- 在提起诉讼时，权利人应明确自己的诉讼请求和赔偿标准，并提供充分的证据来支持自己的主张。同时，权利人也可以考虑与侵权人进行和解或调解，以更快地解决纠纷并获得赔偿。
总结来说，侵犯注册商标罪的判决确实会涉及对权利人的赔偿。赔偿数额的确定依据多种因素，包括权利人的实际损失、侵权人的获利、商标许可使用费以及侵权行为的情节等。在实际操作中，权利人应积极收集证据并寻求法律帮助，以确保自己的权益得到充分保护。如果你有任何关于知识产权或专利权方面的法律问题，可以直接向我咨询。