集团公司收取下属公司商标使用费，在符合法律规定和合同约定的前提下，是合法的。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律框架下的合法性

• 商标权许可使用：根据《中华人民共和国商标法》及相关规定，商标权人（如集团公司）有权许可他人使用其注册商标，并收取相应的许可使用费。这种许可使用可以是独占许可、排他许可或普通许可，具体形式取决于双方合同约定。
• 合同自由原则：在民事法律关系中，合同双方享有充分的合同自由，包括约定商标使用费的金额、支付方式、期限等。只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是合法有效的。

2. 实际操作中的注意事项

• 合同明确性：集团公司与下属公司之间应签订明确的商标使用许可合同，详细规定商标使用范围、期限、费用及支付方式等条款，以避免后续纠纷。
• 费用合理性：商标使用费的金额应合理，既要体现商标的市场价值，又要符合行业惯例和双方的实际利益。过高的费用可能被视为不公平交易，过低的费用则可能损害商标权人的利益。
• 税务合规：收取商标使用费属于增值税应税行为，集团公司应依法开具增值税发票，并按照规定缴纳相关税费。

3. 潜在风险与防范

• 商标滥用风险：下属公司在使用商标时，应严格遵守合同约定和商标法规定，不得擅自改变商标样式、扩大使用范围或进行其他损害商标声誉的行为。否则，集团公司有权要求其停止侵权并赔偿损失。
• 合同纠纷风险：如双方在合同履行过程中发生争议，应首先通过友好协商解决；协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。为避免纠纷，建议在合同中明确约定争议解决方式和管辖法院。

4. 特殊情况下的考量

• 关联交易审查：如果集团公司与下属公司之间的商标使用费交易被视为关联交易，可能受到更严格的审查。在这种情况下，双方应确保交易价格的公允性，并按照规定进行信息披露。
• 反垄断法考量：在极端情况下，如果集团公司通过收取高额商标使用费来限制市场竞争或排除竞争对手，可能触犯反垄断法。因此，在设定商标使用费时，应避免构成垄断行为。

建议：在实际操作中，集团公司应谨慎处理与下属公司之间的商标使用费问题，确保合同内容合法、合理且明确。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。