结论：在海关扣留侵权货物的情况下，知识产权权利人是否需要支付仓储费用，主要取决于货物是否被认定为侵权以及后续的处理方式。若货物最终被认定为侵权，权利人通常无需支付仓储费用；若货物未被认定侵权或权利人未及时处理，则可能需要承担相应仓储费用。以下是对此问题的详细分析：
一、货物被认定为侵权的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国知识产权海关保护条例》的相关规定，海关在调查认定进出口货物侵犯知识产权后，会依法对侵权货物进行没收处理。在此过程中，若货物被认定为侵权，且权利人未提出因货物被扣留而遭受损失的赔偿要求（通常这种要求也不太可能得到支持，因为侵权行为本身是非法的），则权利人无需承担仓储费用。
实际操作：
- 在海关扣留侵权货物后，会进行一系列的调查和认定程序。若最终确认货物侵权，海关会依法没收货物，并可能对其进行销毁或拍卖等处理。在此过程中，仓储费用通常由海关承担，或者作为没收货物处理成本的一部分，不单独向权利人收取。
二、货物未被认定侵权或权利人未及时处理的情况
未被认定侵权：
- 若海关在调查后认为货物不构成侵权，或者权利人未能提供充分证据证明货物侵权，则货物可能会被释放。在此情况下，若货物在扣留期间产生了仓储费用，且该费用未由其他方（如侵权嫌疑人）承担，则权利人可能需要承担这部分费用，尤其是当权利人要求海关继续扣留货物以进行进一步调查或等待其他法律程序时。
权利人未及时处理：
- 即使货物被初步认定为侵权，若权利人未在规定时间内采取进一步行动（如提起诉讼或申请海关继续扣留），海关可能会释放货物。在此情况下，若货物在扣留期间产生了仓储费用，且权利人未及时支付或未与海关就费用承担达成一致，则权利人可能需要承担这部分费用。
三、特殊情况与建议
特殊情况：
- 在某些情况下，海关可能会与权利人就仓储费用的承担达成特别协议。例如，若权利人同意承担部分或全部仓储费用以换取海关更长时间的扣留或更详细的调查，则双方可以签订相关协议明确费用承担方式。
建议：
- 对于知识产权权利人而言，在发现侵权货物并被海关扣留后，应及时与海关沟通并提供充分证据证明货物侵权。同时，权利人应密切关注海关的调查进展和货物处理情况，以便在必要时采取进一步行动。若担心仓储费用问题，权利人可以在与海关沟通时明确提出费用承担方面的关切，并尝试与海关达成特别协议。
总结来说，知识产权权利人在海关扣留侵权货物的情况下是否需要支付仓储费用，取决于货物是否被认定为侵权以及后续的处理方式。为避免不必要的费用支出和法律风险，权利人应积极与海关沟通并提供充分证据支持其主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。