专利侵权案件一般不由县级及以上市场监督部门直接裁决，而是由管理专利工作的部门负责处理，其中涉及诉讼的则由人民法院管辖。以下是对这一问题的详细分析：

一、专利侵权处理的主管部门

1. 管理专利工作的部门：根据《中华人民共和国专利法》及相关规定，管理专利工作的部门负责处理专利侵权纠纷。这些部门通常包括国家知识产权局及其下属的专利局、地方知识产权局等，它们具有专业的知识产权管理职能和执法权力。在专利侵权案件中，这些部门会依据相关法律法规进行调查、取证，并作出相应的处理决定。

2. 市场监督部门与专利侵权的关系：虽然县级及以上市场监督部门在市场监管方面发挥着重要作用，但它们并不直接负责处理专利侵权纠纷。市场监督部门主要关注的是市场秩序、消费者权益保护等方面的问题，而专利侵权纠纷则属于知识产权领域的专门问题，需要由具备专业知识和执法权力的管理专利工作的部门来处理。

二、专利侵权纠纷的处理方式

1. 行政处理：当事人可以向管理专利工作的部门提出专利侵权纠纷处理请求。管理专利工作的部门在受理请求后，会依法进行调查、取证，并根据调查结果作出处理决定。如果认定侵权行为成立，管理专利工作的部门可以责令侵权人立即停止侵权行为，并可以处以罚款等行政处罚。

2. 司法诉讼：如果当事人对管理专利工作部门的处理决定不服，或者希望获得更全面的法律救济，可以向人民法院提起专利侵权诉讼。在诉讼过程中，人民法院会依法审理案件，并作出判决。如果判决侵权行为成立，侵权人需要承担民事责任，包括赔偿损失、停止侵害等。

三、特殊情况下的市场监督部门参与

虽然市场监督部门不直接处理专利侵权纠纷，但在某些特殊情况下，它们可能会与管理专利工作的部门协同工作，共同打击专利侵权行为。例如，在市场监管过程中发现涉嫌专利侵权的商品或行为时，市场监督部门可能会及时将线索移送给管理专利工作的部门，以便其进行进一步调查和处理。

四、建议与提醒

1. 及时维权：如果您发现自己的专利权受到侵害，建议及时向管理专利工作的部门提出处理请求，或者向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

2. 专业咨询：在处理专利侵权纠纷时，由于涉及复杂的法律问题和专业知识，建议您寻求专业律师的帮助。我可以为您提供专业的法律咨询和代理服务，帮助您更好地应对专利侵权纠纷。

3. 加强保护意识：为了预防专利侵权纠纷的发生，建议您加强专利保护意识，及时申请专利并维护专利的有效性。同时，在市场活动中也要注意尊重他人的专利权，避免侵犯他人的合法权益。