公司违法占用林草地五十亩，将面临行政处罚、刑事责任追究以及民事赔偿责任，具体处理方式如下：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国森林法》和《中华人民共和国草原法》的相关规定，公司违法占用林草地的行为，首先会受到林业和草原主管部门的行政处罚。
   • 处罚措施可能包括责令限期恢复植被和林业生产条件、退还非法占用的林地或草地、处以罚款等。罚款的数额会根据违法占用的面积、时间以及造成的损害程度等因素来确定，对于占用五十亩这样较大面积的情况，罚款数额可能会相对较高。

2. 刑事责任追究：

   • 如果公司的违法行为构成犯罪，如非法占用农用地罪，那么相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法占用基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上的，或者其他林地、草地等农用地数量较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。对于占用五十亩林草地的情况，显然已经达到了刑事立案的标准。

3. 民事赔偿责任：

   • 除了行政处罚和刑事责任外，公司还可能需要承担民事赔偿责任。
   • 如果公司的违法行为给林草地的所有者或使用者造成了经济损失，如植被破坏导致的生态损失、土地使用权的丧失等，那么公司需要依法进行赔偿。赔偿的范围和数额会根据实际损失情况来确定，可能包括直接经济损失和间接经济损失等。

行动建议：

• 公司应立即停止违法行为，并主动与林业和草原主管部门联系，说明情况并接受调查处理。
• 积极配合相关部门的调查工作，提供必要的证据和资料，以便准确认定违法事实和责任。
• 根据调查结果和处罚决定，及时履行相关义务，如恢复植被、退还土地、缴纳罚款等。
• 如有必要，可以寻求专业法律帮助，以更好地维护公司的合法权益并应对可能的法律风险。