结论前置：签订协商还款协议并不能完全免除挪用资金行为的刑事责任，但可以作为量刑时的一个考虑因素，具体是否承担责任及责任轻重需根据挪用资金的数额、用途、时间、归还情况以及犯罪人的主观恶性和社会危害程度等因素综合判断。
一、挪用资金罪的基本构成与刑事责任
挪用资金罪是指公司、企业或其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或借贷给他人，且满足以下条件之一即构成犯罪：
- 数额较大、超过三个月未还；
- 虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动；
- 进行非法活动。
一旦构成挪用资金罪，犯罪人将面临刑事责任的追究，包括有期徒刑、拘役等刑罚。
二、协商还款协议对刑事责任的影响
时间因素：
- 如果在挪用资金后三个月内签订还款协议并还清，虽然可能因及时归还而避免某些刑事处罚的严厉性，但并不意味着行为本身无罪。因为挪用资金的行为已经发生，且可能已经满足了挪用资金罪的构成要件。
- 超过三个月未还，即使签订了还款协议，也仍需承担刑事责任。因为此时挪用资金的行为已经持续了一段时间，且可能已经对单位造成了损失。
用途与数额因素：
- 挪用资金数额较大，用于营利活动或非法活动的，无论是否签订还款协议，均构成犯罪。因为这些行为本身就具有较大的社会危害性。
- 挪用资金数额巨大且不退还的，将面临更严重的刑事处罚。因为此时挪用资金的行为已经对单位造成了重大损失，且犯罪人没有表现出悔改的意愿。
法律程序与判决因素：
- 还款协议只是表明挪用人有归还的意愿和计划，但不能作为免除刑事责任的理由。因为刑事责任是基于犯罪行为的性质和社会危害程度来确定的，而不是基于犯罪后的补救措施。
- 挪用人按协议归还资金，可作为量刑时的考虑因素。法院在判决时可能会考虑犯罪人的悔罪表现、归还情况等因素，从而适当从轻或减轻处罚。但这并不意味着可以完全免除刑事责任。
三、实际案例分析
以公司员工甲为例，甲挪用公司资金50万元用于个人炒股，三个月内未能归还。之后公司发现并与甲协商，甲签订了还款协议承诺分期归还。在此情况下，甲挪用资金的行为已经符合挪用资金罪的构成要件，因此依然要被追究刑事责任。然而，鉴于其签订还款协议并愿意积极退赔，法院在量刑时可能会适当从轻。
四、建议与风险提示
- 尽快归还资金：如果已经挪用了单位资金，应尽快归还，以减少对单位的损失和自己的法律责任。
- 积极配合法律程序：在面临法律追究时，应积极配合调查和审判程序，如实陈述事实，提供相关证据。
- 寻求专业法律帮助：由于挪用资金罪涉及复杂的法律问题和刑事责任，建议寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
总结：挪用资金后签订协商还款协议并不能完全免除刑事责任，但可以作为量刑时的一个有利因素。是否构成挪用资金罪以及罪责的轻重，需根据具体情况来判断。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。