首先，公司公章被变更人拿走导致公司被吊销，这是一个比较复杂且严重的问题，涉及到公司法人资格的丧失以及可能由此引发的系列法律后果。关于申请赔偿，我们可以从以下几个角度来分析：

1. 确定责任主体：

   • 首先需要明确是谁拿走了公章，以及这一行为是否直接导致了公司的吊销。如果这一行为是由公司内部人员（如变更人、高管或员工）所为，并且确实导致了公司的吊销，那么这些人员可能需要承担相应的法律责任。
   • 同时，也需要考虑是否有外部因素或第三方机构（如工商登记部门）在办理相关手续时存在过错或疏忽，从而间接导致了公司的吊销。

2. 评估损失：

   • 在确定责任主体后，接下来需要评估公司因被吊销而遭受的具体损失。这包括但不限于公司资产贬值、业务中断、客户流失、信誉损害等直接和间接损失。
   • 评估损失时，建议咨询专业的财务或评估机构，以确保损失计算的准确性和合理性。

3. 选择赔偿途径：

   • 如果责任主体明确且愿意承担赔偿责任，双方可以尝试通过协商或调解的方式解决赔偿问题。
   • 如果协商不成或责任主体拒绝承担赔偿责任，公司（或其债权人、股东等利害关系人）可以向人民法院提起诉讼，要求责任主体承担相应的赔偿责任。

4. 准备证据材料：

   • 在申请赔偿的过程中，证据材料是至关重要的。公司需要收集并整理所有与公章被拿走、公司被吊销以及由此引发的损失相关的证据材料，如公章使用记录、工商登记资料、财务报表、客户名单等。
   • 这些证据材料将有助于证明责任主体的过错、公司的损失以及两者之间的因果关系。

5. 注意法律程序：

   • 在申请赔偿的过程中，公司需要遵循相关的法律程序。例如，在提起诉讼前，可能需要先履行前置程序（如通知责任主体、申请调解等）。
   • 同时，公司也需要了解并遵守法院关于诉讼程序的相关规定，如提交诉状、举证质证、参加庭审等。

综上所述，申请赔偿是一个复杂且耗时的过程，需要公司全面评估自身情况并准备充分的证据材料。如果你在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。