农村五荒地若被纳入永久基本农田，一般不能直接确权为原使用者的“五荒地”承包经营权，但可能根据具体情况确权为基本农田的承包经营权或其他合法权利。以下从不同角度进行分析：

1. “五荒地”与永久基本农田的性质差异
   “五荒地”通常指未开发利用的荒山、荒沟、荒丘、荒滩、荒沙等土地，其承包经营权需通过拍卖、招标、公开协商等方式取得，且用途可能包含造林、种草、养殖等非农用途（需符合规划）。而永久基本农田是依法划定的、需长期稳定利用的优质耕地，用途严格限定为粮食生产，禁止擅自改变用途或非农建设。
   若“五荒地”被纳入永久基本农田，其土地性质已从“未利用地”或“其他农用地”转变为“耕地”，原“五荒地”的承包经营权可能因用途变更而无法直接延续，需按基本农田管理规则重新确权。

2. 确权的可能性与条件

   • 若原“五荒地”承包合同明确约定可调整用途：若承包合同中约定了土地用途变更时的处理方式（如转为耕地后承包权延续），且符合《农村土地承包法》中“依法调整承包地”的程序（如经村民会议三分之二以上成员同意），可能确权为基本农田的承包经营权，但需重新签订合同并登记。
     
   • 若原承包合同未约定或用途变更未履行程序：原“五荒地”承包经营权可能因违反基本农田保护规定而无效，土地由集体收回后重新发包或确权为集体所有，使用者可能仅享有临时经营权或需通过其他合法方式取得权利。
     
   • 历史遗留问题：若“五荒地”在纳入基本农田前已通过合法程序开发为耕地（如开垦为果园、菜地），且符合基本农田划定标准，可能直接确权为基本农田的承包经营权，但需补办相关手续。

3. 法律程序与风险

   • 确权主体：基本农田的确权通常由县级人民政府土地管理部门主导，需结合土地调查、规划调整等程序进行，使用者需主动申请并提交承包合同、开发证明等材料。
     
   • 风险点：若“五荒地”纳入基本农田未履行法定程序（如未公告、未听证），或原承包合同存在违法条款（如约定非农用途），确权申请可能被驳回，甚至面临行政处罚（如恢复土地原状、罚款）。

建议：若您的“五荒地”被纳入永久基本农田，需第一时间核查原承包合同条款、土地开发情况及纳入基本农田的法定程序，必要时携带相关材料向我咨询具体确权路径及风险规避方案。