关于工伤保险条款中再次申请劳动能力鉴定的鉴定费及交通费的承担问题，这确实是一个涉及具体情形和法律规定的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律原则与基础规定
根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤职工因劳动能力鉴定产生的合理费用，原则上应从工伤保险基金支付。然而，对于再次申请劳动能力鉴定（即重新鉴定）的特殊情况，费用承担需根据具体情形来区分。
二、不同情形下的责任划分
初次鉴定结论被推翻
- 若重新鉴定结果改变原结论（如伤残等级调整），这通常表明初次鉴定存在错误。
- 用人单位申请重新鉴定：因质疑初次结论而产生的费用，包括鉴定费和合理的交通费，通常由用人单位承担。
- 社保机构申请重新鉴定：若因社保审核发现疑点而启动重新鉴定，相关费用由工伤保险基金支付。
初次鉴定结论被维持
- 若重新鉴定结果与初次一致，说明原结论正确。
- 用人单位申请重新鉴定：这属于无正当理由的重复申请，因此产生的鉴定费和交通费应由用人单位自行承担。
- 工伤职工申请重新鉴定：除非能证明初次鉴定存在重大瑕疵，否则费用一般由申请人（即工伤职工）承担。但在此情况下，若工伤职工能提供充分证据证明初次鉴定存在问题，且重新鉴定是必要的，那么部分或全部费用可能由工伤保险基金或用人单位承担，具体需根据实际情况和当地规定判断。
第三方责任导致重新鉴定
- 若因鉴定机构过错（如程序违规、鉴定人员失误等）导致需要重新鉴定，相关费用应由该鉴定机构承担。
三、交通费的具体处理
- 一般原则：工伤职工为进行劳动能力鉴定所产生的合理交通费用，应视为与工伤相关的必要支出。在初次鉴定或合理的重新鉴定情况下，这部分费用通常应由用人单位或工伤保险基金承担。
- 特殊情况：若重新鉴定是由用人单位无正当理由申请的，且结论未变，那么工伤职工往返的交通费应由用人单位承担。若工伤职工自行申请重新鉴定且结论未变，除非能证明初次鉴定存在重大问题，否则交通费一般由工伤职工自行承担。
四、争议解决途径
- 协商处理：双方可依据实际情况协商分担比例，例如用人单位与职工各承担一部分费用。
- 行政救济：向当地人社部门申请调解，由其根据相关法律法规裁定费用归属。
- 司法途径：对行政裁定不服时，可通过劳动仲裁或诉讼解决。法院将审查申请动机、鉴定结论变化等因素，作出公正裁决。
五、建议
- 保留证据：工伤职工在申请重新鉴定时，应保留好所有相关证据，包括交通票据、鉴定费用发票等，以便在需要时证明费用的合理性和必要性。
- 咨询专业人士：若对费用承担问题存在疑问或争议，建议咨询当地劳动保障部门或专业律师，以获取更准确和具体的法律建议。
综上所述，工伤保险条款中再次申请劳动能力鉴定的鉴定费及交通费的承担问题，需根据具体情形和法律规定综合判断。希望以上解答能对您有所帮助。