在综合工时制下，加班工资的计算确实是一个涉及多个因素的问题，但别担心，我会为您详细解释清楚。

首先，我们要明确综合工时制的基本概念。综合工时制是以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间的一种工时制度。它的特点是，在综合计算周期内，某一具体日或周的实际工作时间可以超过8小时或40小时，但总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。

接下来，我们来看加班工资的计算方法。加班工资的计算主要依据加班时长、时薪以及加班系数来确定。

1. 加班时长的确定：

   • 在综合计算周期内，劳动者实际工作时间超过法定标准工作时间的部分视为加班时长。
   • 加班时长 = 总实际工作时间 - 总法定标准工作时间。

2. 时薪的计算：

   • 时薪是员工的正常小时工资，计算公式为：月工资收入 ÷ 月计薪天数（通常为21.75天）÷ 8小时。

3. 加班系数的确定：

   • 法定节假日加班：无论是否补休，都应支付不低于员工本人日或小时工资的300%作为加班工资，即加班系数为3。
   • 休息日加班：如果不能安排补休，则应支付不低于员工本人日或小时工资的200%作为加班工资，即加班系数为2。如果能安排补休，则无需支付加班工资。
   • 延长工作时间加班：在法定工作时间内安排了延长工作时间，应支付不低于员工本人小时工资的150%作为加班工资，即加班系数为1.5。

4. 加班工资的计算公式：

   • 加班工资 = 加班时长 × 时薪 × 加班系数。

示例说明： 假设某员工月工资为6000元，实行以月为周期的综合工时制。某月总实际工作时间为240小时，而该月的总法定标准工作时间为167小时（按每月平均20.83天，每天8小时计算）。

1. 计算时薪：

   • 时薪 = 6000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 ≈ 34.48元/小时。

2. 计算加班时长：

   • 加班时长 = 240小时 - 167小时 = 73小时。

3. 假设加班类型并计算加班工资：

   • 假设这73小时中有10小时是在法定节假日工作的，其余63小时是在休息日或延长工作时间工作的（这里为了简化计算，我们统一按休息日加班系数2来处理，实际情况应根据具体加班时间来分别计算）。
   • 法定节假日加班工资 = 10小时 × 34.48元/小时 × 3 = 1034.4元。
   • 休息日加班工资 = 63小时 × 34.48元/小时 × 2 = 4344.48元（若严格区分，需根据实际加班情况分别计算）。
   • 总加班工资 = 1034.4元 + 4344.48元 = 5378.88元。

注意事项：

• 劳动者应妥善保存加班证据，如考勤记录、工作记录等，以备劳动争议时使用。
• 用人单位与劳动者可在劳动合同中明确加班工资的计算方式，但不得违反法律法规的强制性规定。
• 每月延长工作时间不得超过36小时，超时部分仍按150%计算加班工资。
• 特殊行业、企业和工作岗位可能实行不同的综合工时制规定，计算加班工资时需考虑当地实际情况和相关规定。

希望这个解释能帮助您更好地理解综合工时制下加班工资的计算方法。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。