已转让但没有过户的海域，在存在争议的情况下，通常应认定为使用权属不明确或不清晰。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律层面分析
物权变动原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。海域使用权作为一种不动产物权，其转让应当依法进行登记，未经登记，其物权变动不发生法律效力。
登记的公示公信力：
- 登记是物权变动的重要公示方式，具有公信力。未经登记的海域使用权转让，无法对抗善意第三人，也难以在法律上确认其权属的明确性和清晰性。在存在争议的情况下，未过户的海域使用权更难以被认定为权属明确。
二、实际操作层面分析
争议解决难度：
- 在海域使用权转让未过户且存在争议的情况下，双方可能就权属问题产生纠纷。由于未进行登记，双方可能缺乏有效的证据来证明自己的权属主张，导致争议解决难度增加。
风险承担：
- 对于受让方而言，未过户的海域使用权存在较大的风险。如果转让方在转让后反悔或涉及其他法律纠纷，受让方可能面临权属被撤销或无法行使使用权的风险。
三、建议与措施
及时办理过户手续：
- 为避免权属争议和风险，双方应在转让协议签订后及时办理海域使用权的过户手续，确保物权变动的合法性和有效性。
完善转让协议：
- 在签订转让协议时，双方应明确约定权属变更、过户时间、违约责任等条款，以减少争议和风险。同时，可以约定在过户前由转让方继续承担使用权的相关责任和义务。
寻求法律帮助：
- 如果双方在转让过程中遇到法律问题或争议，应及时寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决争议，维护自己的合法权益。
总结来说，已转让但没有过户的海域，在存在争议的情况下，由于未依法进行登记，其使用权属通常难以被认定为明确或清晰。因此，双方在转让海域使用权时，应严格遵守法律规定，及时办理过户手续，并完善转让协议，以减少争议和风险。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。