药店只发半个月工资是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
一、正常发薪周期下的情况
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
- 这意味着，在正常情况下，用人单位应当每月至少支付一次工资给劳动者。
药店行为分析：
- 如果药店与劳动者之间有明确的约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定（例如，双方约定每月中旬发放上月工资，且药店确实按照此约定执行），那么药店只发半个月工资（作为上月工资的一部分，且后续会补发剩余部分）可能并不构成违法。但这种情况较为特殊，且需要双方有明确的书面约定。
- 如果药店没有与劳动者进行明确约定，或者约定违反了法律法规的强制性规定（例如，约定每月只发半个月工资，剩余部分无限期拖延），那么药店的行为就可能构成违法。
二、特殊情况下的发薪
试用期发薪：
- 在试用期内，用人单位也应当按照劳动合同的约定支付工资。如果试用期工资支付方式（如只发半个月）与劳动合同约定不符，且没有合理理由，那么药店的行为可能违法。
离职或解雇时的发薪：
- 如果劳动者离职或被解雇，药店应当按照法律法规和劳动合同的约定，及时结清劳动者的工资。如果药店只发半个月工资作为离职或解雇时的工资结算，且没有合理理由（如劳动者存在严重违纪行为等），那么药店的行为可能违法。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 如果药店的行为构成违法，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉，要求药店支付拖欠的工资，并可能要求药店支付赔偿金。
- 在严重情况下，药店还可能面临行政处罚或法律诉讼。
建议：
- 劳动者应当首先与药店进行沟通，了解工资发放的具体原因和情况。
- 如果沟通无果，劳动者可以收集相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等），向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在整个过程中，劳动者应当保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。
总结来说，药店只发半个月工资是否合法，取决于具体情况和双方之间的约定。如果药店的行为违反了法律法规的强制性规定或劳动合同的约定，那么劳动者有权依法维护自己的权益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。