结论：在男方主动协议离婚而女方选择诉讼离婚，且分居未满两年的情况下，法院不一定会判决离婚，但若存在其他导致夫妻感情破裂的情形，法院仍有可能判决离婚。
法律分析：
分居未满两年的情况：
- 根据《民法典》第1079条的规定，因感情不和分居满二年是法院判决离婚的一个法定情形。但此处的“分居满二年”是作为一个明确的条件，若未满足这一条件，法院通常不会仅凭分居未满两年就判决离婚。
其他导致夫妻感情破裂的情形：
- 除了分居满二年外，《民法典》还规定了其他几种导致夫妻感情破裂的情形，如重婚或与他人同居、实施家庭暴力或虐待遗弃家庭成员、有赌博吸毒等恶习屡教不改等。若女方能证明存在这些情形之一，即使分居未满两年，法院也有可能判决离婚。
调解与证据的重要性：
- 在离婚诉讼中，法院会首先进行调解，若调解无效且感情确已破裂，才会判决离婚。因此，女方在提起诉讼时，应尽可能提供充分的证据来证明夫妻感情已经破裂，如聊天记录、证人证言、照片视频等。
律师观点与建议：
- 证据收集：女方在提起诉讼前，应尽可能收集能够证明夫妻感情破裂的证据，这些证据将直接影响法院的判决结果。
- 法律咨询：由于离婚诉讼涉及复杂的法律程序和证据规则，建议女方在提起诉讼前咨询专业律师，以更好地了解自己的权利和义务，以及诉讼的可能结果。
- 考虑其他途径：若女方希望尽快解决离婚问题，也可以考虑与男方进行协商，看是否能够达成离婚协议，并通过民政局办理离婚登记手续，这样通常比诉讼离婚更为快捷和简便。
后续行动建议：
- 若女方决定提起诉讼离婚，应尽快准备相关证据材料，并咨询专业律师以制定合适的诉讼策略。
- 在诉讼过程中，女方应积极配合法院的调解工作，并坚持自己的诉讼请求，同时尊重法院的判决结果。
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