员工在一般情况下有权拒绝跨年度安排的年休假，但若单位因生产、工作特点确有必要且与员工协商一致，员工则不能拒绝。以下是对此问题的详细分析：
一、年休假的法律性质与员工权利
年休假是劳动者的合法权益，受《职工带薪年休假条例》等法律法规保护。符合条件的员工（连续工作1年以上）有权享受带薪年休假，且单位应保证职工享受此权利。员工有权自主决定是否休年休假，这是其基本的劳动权益之一。
二、跨年度安排年休假的法律规定与员工选择
法律规定：
- 根据《职工带薪年休假条例》及相关规定，单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。但这一安排必须与员工协商并取得其同意。
员工选择：
- 在单位提出跨年度安排年休假的情况下，员工有权根据自己的实际情况和意愿选择是否接受。如果员工认为跨年度安排年休假会影响其个人计划或休息权益，可以拒绝单位的安排。
- 若员工同意跨年度安排年休假，则应按照单位的安排进行休假，并享受相应的带薪待遇。
三、特殊情况下的年休假安排与员工权益保护
紧急任务或特殊情况：
- 如遇突发事件、紧急任务等特殊情况，公司可能需要员工暂时放弃年假投入工作。在此情况下，公司应事先与员工进行沟通，并说明情况。
- 若员工同意放弃年假，公司事后应安排员工补休年假；若确实无法安排补休，则应按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，以作为未能休假的补偿。
员工权益保护：
- 如果公司无正当理由拒绝员工休年假，或者未经员工同意擅自跨年度安排年休假，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 与公司进行协商，要求给予合理的解释和补偿；
- 向当地劳动监察部门投诉，寻求法律援助；
- 在必要时，通过劳动仲裁或诉讼等法律途径解决争议。
四、实际操作建议
- 对于员工：在面对跨年度安排年休假的情况时，应仔细考虑自己的实际情况和意愿，并与单位进行充分沟通。如果认为跨年度安排会影响自己的权益，可以明确拒绝并要求单位按照法律规定进行安排。
- 对于单位：在安排年休假时，应充分考虑员工的意愿和实际情况，尽量做到合理安排。如果因生产、工作特点确有必要跨年度安排年休假，应事先与员工进行协商并取得其同意，以确保员工的合法权益得到保障。
综上所述，员工在跨年度安排年休假的问题上享有一定的自主权。如果单位未经员工同意擅自安排跨年度年休假，员工有权拒绝并维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。