结论：在拍卖取得土地后通过三方协议变更受让人的情况下，印花税的缴纳责任通常取决于协议的具体内容以及相关法律法规的规定。一般来说，印花税可能由原受让人、新受让人或三方共同承担，具体需根据协议约定和实际情况判断。

分析说明：

1. 印花税的基本规定：

   • 印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证（如合同、产权转移书据等）所征收的一种税。
   • 在土地拍卖和转让过程中，涉及的相关合同（如拍卖成交确认书、土地转让合同等）通常需要缴纳印花税。

2. 三方协议变更受让人的情况：

   • 当通过三方协议变更土地受让人时，这实际上构成了一个新的土地转让行为，可能涉及新的合同签订和印花税缴纳。
   • 印花税的缴纳责任通常会在协议中明确约定。如果协议中没有明确约定，则可能需要根据相关法律法规和交易习惯来判断。

3. 可能的缴纳责任方：

   • 原受让人：如果原受让人在拍卖过程中已经缴纳了印花税，且三方协议中未明确约定由新受让人承担后续印花税，则原受让人可能不再承担额外印花税。但需注意，如果原受让人与新受让人之间的转让行为被视为一个新的交易，则可能仍需缴纳印花税。
   • 新受让人：如果三方协议中明确约定由新受让人承担印花税，或者根据相关法律法规和交易习惯，新受让人应作为印花税的纳税人，则新受让人需要缴纳印花税。
   • 三方共同承担：在某些情况下，三方可能协商一致共同承担印花税，这通常会在协议中明确约定。

4. 实际操作建议：

   • 在签订三方协议前，应仔细审查协议条款，明确印花税的缴纳责任方。
   • 如果对印花税的缴纳责任有疑问或不确定，建议咨询当地税务机关或专业律师以获取准确指导。
   • 在实际操作中，应确保按照相关法律法规和协议约定及时、足额缴纳印花税，以避免可能的税务风险和法律责任。

特殊场景：

• 如果三方协议中的变更受让人行为被税务机关认定为逃避印花税缴纳的行为，则可能面临税务处罚和法律责任。因此，在签订协议和进行交易时，应确保合规性并遵守相关法律法规。

后续行动建议：

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