股东出资纠纷涉及不动产时，管辖法院的确定需结合纠纷性质及法律规定综合判断，具体如下：

1. 若纠纷核心为股东出资义务履行（如未足额出资、虚假出资等），且不动产仅为出资标的物
   此类纠纷本质属于公司股东与公司之间的出资争议，应适用《民事诉讼法》中“与公司有关的纠纷”管辖规则，即由公司住所地人民法院管辖（公司住所地指公司主要办事机构所在地，无主要办事机构的，以其注册地为准）。
   法律依据：《民事诉讼法》第27条“因公司设立、确认股东资格、分配利润、解散等纠纷提起的诉讼，由公司住所地人民法院管辖”；《公司法解释（三）》第12条、第13条等条款对出资纠纷的实体认定作出规定，但未突破管辖规则。

2. 若纠纷涉及不动产权利归属或物权变动（如股东以不动产作价出资，但未办理过户登记引发争议）
   此时纠纷可能同时涉及出资合同履行与不动产物权变动，需区分情形：

   • 若争议焦点为“不动产是否应过户至公司名下”：仍以公司住所地法院管辖为主，因出资义务履行是核心法律关系，不动产过户仅是履行方式。
     
   • 若争议焦点为“不动产权属确认或物权变动效力”（如股东主张已实际交付不动产但未过户，要求确认权属）：可能适用《民事诉讼法》第34条“因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖”。但需注意，此类情形需严格符合“不动产权利确认、分割、相邻关系等物权纠纷”的构成要件，单纯因出资合同履行引发的过户争议不适用专属管辖。
     实践提示：司法实践中，法院可能根据“主要法律关系”原则，优先以出资纠纷确定管辖，但若不动产权属争议明显独立于出资合同（如涉及第三人权利、多重物权变动等），可能适用专属管辖。

3. 若纠纷涉及股东出资与不动产抵押、查封等执行程序交叉
   例如，公司债权人申请执行股东名下不动产以清偿债务，股东主张该不动产已出资但未过户，此时需通过执行异议之诉解决，管辖法院为执行法院（即采取执行措施的法院）。
   法律依据：《民事诉讼法解释》第304条“执行异议之诉由执行法院管辖”。

总结建议：股东出资纠纷涉及不动产时，优先以公司住所地法院管辖为原则；若争议实质为不动产权属确认或物权变动，且符合专属管辖构成要件，则由不动产所在地法院管辖；涉及执行程序的，由执行法院管辖。具体案件需结合争议焦点、合同履行情况及物权变动状态综合判断，建议提供详细案情后进一步分析。