针对您作为执业药师想要辞职但老板不批准的情况，首先，我们需要明确的是，辞职是您的个人权利，但同时也需要遵循一定的法律程序和职业道德规范。以下是一些建议，希望能帮助您妥善处理这个问题：
一、了解辞职的法律规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者有权提前通知用人单位解除劳动合同。具体来说，如果您在试用期内，提前三日通知用人单位即可；如果您已经过了试用期，那么需要提前三十日以书面形式通知用人单位。这是您的法定权利，老板无权阻止。
二、与老板进行沟通
书面提出辞职：为了确保有证据证明您已经提出了辞职，建议您以书面形式（如邮件、信件或辞职信）向老板提出辞职申请，并明确说明您的辞职日期和原因。
沟通协商：在提出辞职后，您可以与老板进行面对面的沟通，解释您辞职的原因和计划，并尝试协商一个双方都能接受的离职日期。在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的表达。
三、处理可能的阻碍
老板不批准：如果老板在收到您的辞职申请后仍然不批准，您可以再次强调您的法定权利，并告知老板您将按照法律规定的时间离职。如果老板仍然坚持不批准，您可以考虑向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
工作交接：在离职前，您需要与老板或接替您工作的人员进行工作交接，确保工作的连续性和稳定性。这是您的职业道德责任，也有助于维护您的职业声誉。
四、关注执业药师注册问题
虽然您辞职的问题主要与劳动合同和劳动关系有关，但作为执业药师，您还需要关注您的注册问题。根据《执业药师注册管理办法》的规定，执业药师注册需经执业单位同意。如果您已经找到了新的工作单位，并且新单位同意您以执业药师身份执业，那么您需要在离职后及时办理变更注册手续，将您的执业单位变更为新单位。
五、保持职业操守
在整个辞职过程中，无论遇到什么困难和阻碍，都请您保持职业操守和道德底线。不要采取过激或违法的行为来解决问题，以免给自己和他人带来不必要的麻烦和损失。
综上所述，作为执业药师想要辞职但老板不批准时，您应该首先了解辞职的法律规定，与老板进行沟通协商，处理可能的阻碍，并关注执业药师注册问题。同时，保持职业操守和道德底线也是非常重要的。希望这些建议能对您有所帮助。