结论：在对方投标文件不响应招标文件结算条款，而我方同意的情况下，是否按照对方新的投标文件签订合同，需分情况讨论，具体如下：

1. 若双方协商一致，且新条款不违反法律法规强制性规定：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，只要双方就合同条款达成一致，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同即成立并有效。
   • 法律建议：在此情况下，若我方同意对方新的投标文件中的结算条款，且该条款合法合规，双方可以按照新的投标文件签订合同。但建议将协商过程及结果以书面形式固定下来，作为合同的一部分，以避免未来可能出现的纠纷。
   • 可能后果：若双方按照新的投标文件签订合同，并履行了各自的义务，则合同将顺利执行，双方权益得到保障。若未来出现纠纷，书面合同将成为解决纠纷的重要依据。

2. 若双方协商不一致，或新条款违反法律法规强制性规定：

   • 法律背景：同样根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，若双方就合同条款无法达成一致，或合同条款违反法律、行政法规的强制性规定，合同将无法成立或无效。
   • 法律建议：在此情况下，若我方不同意对方新的投标文件中的结算条款，或认为该条款违法违规，双方应继续协商，寻求双方都能接受的解决方案。若协商无果，我方可以考虑拒绝签订合同，或寻求法律途径解决纠纷。
   • 可能后果：若双方无法就合同条款达成一致，合同将无法签订，双方可能因此错失合作机会。若我方认为对方新的投标文件中的结算条款违法违规，并坚持签订合同，未来可能面临法律风险，如合同被认定无效、承担违约责任等。

额外建议：

• 在处理此类问题时，建议我方仔细审查对方新的投标文件中的结算条款，确保其合法合规，并符合我方的利益需求。
• 若可能，建议我方在签订合同前咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性，并降低未来可能出现的法律风险。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。