结论：在离婚纠纷中，怀疑男方有生理问题，一般情况下不可以直接要求司法鉴定，但在特定条件下，如男方同意或法院认为有必要且符合法定程序时，可能可以进行相关鉴定。以下是对此问题的详细分析：

一、一般情况下的不可要求性

1. 隐私权保护：生理问题属于个人隐私范畴，受到法律的保护。在离婚纠纷中，除非双方同意或法律有特别规定，否则一方无权单方面要求另一方进行生理方面的司法鉴定。
2. 鉴定必要性：离婚纠纷主要解决的是夫妻感情是否破裂、财产如何分割、子女抚养权归属等问题。生理问题虽然可能影响夫妻生活，但并非离婚的法定理由，除非该问题严重到导致夫妻感情破裂且无法修复。因此，在一般情况下，法院不会主动要求或允许一方对另一方进行生理方面的司法鉴定。

二、特定条件下的可能性

1. 男方同意：如果男方同意进行生理方面的司法鉴定，并且双方能够就鉴定机构、鉴定内容等达成一致意见，那么可以进行相关鉴定。但这种情况下的鉴定结果通常仅作为双方协商或法院判决的参考依据，而非决定性因素。
2. 法院认为有必要：在极少数情况下，如果法院认为男方的生理问题可能对离婚纠纷的解决产生重大影响（例如，该问题直接导致夫妻感情破裂且无法修复），并且符合法定程序和条件，法院可能会要求或允许进行相关鉴定。但这种情况非常罕见，且需要严格的法律程序和证据支持。

三、法律建议

1. 协商解决：如果怀疑男方有生理问题，并且这个问题对夫妻关系产生了严重影响，建议首先尝试通过协商的方式解决。双方可以坦诚地沟通，寻求专业的医疗帮助或心理咨询，以改善夫妻关系或达成离婚协议。
2. 收集证据：如果协商无果，并且确实认为男方的生理问题是导致夫妻感情破裂的主要原因，那么可以尝试收集相关证据（如医疗记录、证人证言等）来支持自己的主张。但需要注意的是，这些证据必须合法、真实、有效，并且能够直接证明男方的生理问题与夫妻感情破裂之间的因果关系。
3. 寻求法律帮助：在离婚纠纷中，如果涉及复杂的法律问题或证据收集困难，建议寻求专业的法律帮助。作为一名专注于婚姻家庭领域的律师，我可以为你提供全面的法律咨询和代理服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。

最后，离婚纠纷中的生理问题鉴定并非易事，需要严格的法律程序和证据支持。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。