申请财产保全并不意味着双方银行卡都会被冻结。财产保全的目的是为了确保将来判决能够得到有效执行，防止当事人转移、隐匿财产。在具体操作中，是否冻结银行卡以及冻结哪些银行卡，取决于多个因素，以下从不同角度为您详细分析：
申请保全的一方与被保全财产的关系：
- 如果申请保全的一方能够明确指出被保全财产（如特定银行账户）属于被保全人所有，且该财产与案件有直接关联，那么法院通常会只冻结该特定账户，而不会冻结申请保全一方的银行卡。
- 在某些情况下，如果申请保全的一方提供了足够的担保，并且法院认为有必要，也可能会对申请保全一方的某些财产采取保全措施，但这并非普遍现象，且需要严格的法律程序和条件。
被保全人的财产状况：
- 如果被保全人拥有多个银行账户，法院可能会根据案件需要和被保全人的财产状况，选择冻结部分或全部账户。但通常不会无故冻结与案件无关的账户。
- 如果被保全人没有足够的财产可供保全，或者其财产难以查封、扣押、冻结，法院可能会根据实际情况决定不采取保全措施或采取其他保全方式。
法院的裁量权：
- 法院在决定是否采取保全措施以及采取何种保全措施时，会综合考虑案件的性质、争议标的的大小、当事人的财产状况、申请保全的理由是否充分等多种因素。
- 法院有权根据案件的具体情况，灵活决定保全的范围和方式，以确保保全措施的合法性和有效性。
法律程序与救济途径：
- 如果被保全人认为法院的保全措施不当或侵犯了其合法权益，可以依法向法院提出异议或申请复议。
- 在异议或复议期间，法院可能会暂停执行保全措施，或者根据审查结果调整保全措施。
法律建议：
- 如果您是申请保全的一方，建议您在申请时尽可能提供准确、详细的被保全财产信息，以便法院能够有针对性地采取保全措施。
- 如果您是被保全人，且认为法院的保全措施不当或侵犯了您的合法权益，建议您及时咨询专业律师，了解异议或复议的程序和要求，并依法维护自己的权益。
可能后果：
- 如果法院采取了不当的保全措施，可能会给被保全人造成不必要的经济损失和困扰。
- 如果被保全人未能在法定期限内提出异议或申请复议，可能会丧失救济的机会。
总之，申请财产保全并不意味着双方银行卡都会被冻结。法院会根据案件的具体情况和法律规定，灵活决定保全的范围和方式。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。