如果您因为两次闯红灯而被扣了12分，这确实是一个需要认真对待的问题。不过别担心，接下来我会为您详细解答应该如何处理这种情况，并恢复您的驾驶证正常使用。
一、确认违章信息并缴纳罚款
首先，您需要通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如“交管12123”）或者前往当地车管所，查询并确认您的闯红灯违章记录。这包括违章的具体时间、地点以及相关的照片证据，确保信息的准确性。确认无误后，您需要携带驾驶证、车辆行驶证和身份证，前往当地交警大队的违法处理窗口，或者通过线上渠道，按照规定缴纳罚款。请注意，逾期未缴纳罚款可能会产生滞纳金。
二、参加满分学习与考试
在缴纳罚款后的15日内，您需要到机动车驾驶证核发地或者违法行为地的公安机关交通管理部门，报名参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识的学习。这个学习可以通过现场报名或者线上预约的方式进行，每日的学习时间通常不少于8个学时。学习内容涵盖了道路交通安全法律、法规、规章，交通信号的含义，以及安全行车和文明驾驶的知识等。
学习结束后，车辆管理所会在20日内安排您参加道路交通安全法律、法规和相关知识考试，也就是科目一考试。您需要提前预约考试时间，并按时参加。如果考试合格，您的记分将被清除，机动车驾驶证也会发还给您。如果考试不合格，您需要重新预约并参加考试，直到合格为止。
三、特殊情况处理
如果您因为特殊情况，比如视线被遮挡等误闯了红灯，您可以在收到违法信息后向车辆管理处申请复议，并提供相关证据。如果复议成功，红灯记录将被取消，您既不会被扣分也不会被罚款。
另外，如果您持有的是大型客车（A1）、牵引车（A2）、城市公交车（A3）、中型客车（B1）或者大型货车（B2）的驾驶证，在一个记分周期内记满12分，车辆管理所将会注销您的最高准驾车型驾驶资格。您需要在三十日内办理降级换证业务，降级后还需要按规定参加审验学习。
四、重要注意事项
在处理这个问题的过程中，有几点需要您特别注意：
不可代扣：严禁使用他人的驾驶证来代扣您的分数，这种行为属于“买卖分”，是违法的，将会受到严厉的处罚。
遵守交规：在处理完这次违章后，您一定要严格遵守交通规则，避免再次发生类似的违法行为，确保自己和他人的行车安全。
总的来说，虽然因为两次闯红灯被扣12分是一个比较严重的问题，但只要您按照规定的流程去处理，积极学习交通法规，提高自己的交通安全意识，就一定能够顺利恢复驾驶证的正常使用。同时，也希望您能够以此为鉴，今后更加严格地遵守交通规则，共同维护道路交通的秩序和安全。