劳务派遣员工的产假工资主要由劳务派遣单位负责支付，但如果劳务派遣单位与用工单位在协议中有特别约定，且该约定不违反法律法规，则按约定执行。同时，若劳务派遣单位为员工缴纳了生育保险，产假期间的工资将由生育保险基金以生育津贴的形式支付。以下是对这一问题的详细分析：
一、工资发放主体
劳务派遣单位作为用人单位：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是法律上的用人单位，应履行对劳动者的义务，包括支付劳动报酬。因此，劳务派遣员工的工资，包括产假工资，原则上由劳务派遣单位发放。
用工单位的支付责任（基于约定）：
- 若劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中明确约定由用工单位支付产假工资，且该约定合法有效，则用工单位需承担支付责任。例如，双方可以在协议中约定，用工单位在特定条件下（如员工在用工单位工作满一定年限）承担产假工资支付责任。
- 如无此约定或约定不明确，仍由劳务派遣单位支付。
生育保险基金的支付（符合参保条件）：
- 若劳务派遣单位为员工缴纳了生育保险，根据《中华人民共和国社会保险法》第五十四条，产假期间的工资将由生育保险基金以生育津贴的形式支付。生育津贴的发放标准通常按照用人单位上年度职工月平均工资的标准计算。
二、产假工资发放标准
已参加生育保险：
- 生育津贴按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付。这意味着，如果劳务派遣单位为员工缴纳了生育保险，员工在产假期间将获得与用人单位上年度职工月平均工资相当的生育津贴。
未参加生育保险：
- 由劳务派遣单位按照女职工产假前的工资标准支付产假工资。在这种情况下，劳务派遣单位应确保产假工资不低于当地最低工资标准，以保障员工的基本生活需求。
三、工资发放保障
按时足额支付：
- 劳务派遣单位应按照劳动合同约定的工资数额、支付方式和支付周期等发放产假工资。如果劳务派遣单位未按时足额支付产假工资，员工有权要求其支付拖欠的工资，并可能获得相应的经济补偿。
劳动者权益保护：
- 若劳务派遣单位未依法发放产假工资，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。劳动监察部门将依法对劳务派遣单位进行调查处理，并要求其支付拖欠的工资和可能的赔偿金。
- 用工单位在发现劳务派遣单位未依法支付产假工资时，有义务督促其及时整改。如果用工单位未履行督促义务，也可能承担相应的法律责任。
四、实际操作建议
明确约定：
- 在劳务派遣协议中，应明确约定被派遣劳动者在产假期间的工资支付方式和标准。这有助于避免双方因责任不清而产生纠纷，并保障员工的合法权益。
及时沟通：
- 当被派遣劳动者提出产假申请时，劳务派遣单位和用工单位应及时沟通并协商确定产假工资的支付事宜。这有助于确保员工在产假期间能够按时获得工资，并维护双方的合作关系。
依法支付：
- 劳务派遣单位和用工单位应按照法律法规和劳务派遣协议的约定，及时足额支付被派遣劳动者在产假期间的工资。这有助于维护员工的合法权益，并避免可能的法律纠纷。
举例说明：假设某劳务派遣员工小李在用工单位工作期间怀孕并计划休产假。如果劳务派遣单位为小李缴纳了生育保险，那么小李在产假期间将获得生育保险基金支付的生育津贴。如果劳务派遣单位未为小李缴纳生育保险，则小李的产假工资应由劳务派遣单位按照其产假前的工资标准支付。如果劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中明确约定由用工单位支付产假工资，且该约定合法有效，则小李的产假工资将由用工单位支付。
总结来说，劳务派遣员工的产假工资发放问题涉及多个主体和法律规定。在实际操作中，应首先确认劳务派遣单位与用工单位之间的协议内容，以及是否参加了生育保险。如果遇到相关问题或纠纷，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。