合作协议补充协议要生效，需满足以下核心条件：

1. 主体适格
   补充协议的签订主体必须与原合作协议的主体一致。若原协议是甲乙双方签订，补充协议也需由甲乙双方签署，任何一方不得擅自引入第三方作为补充协议主体（除非原协议明确授权或双方另行达成一致）。若主体发生变更（如公司分立、合并），需提供合法变更证明文件。

2. 内容合法且不冲突

   • 补充协议的内容需符合《民法典》《公司法》等法律法规，不得违反强制性规定（如禁止流通物交易、损害社会公共利益等）。
     
   • 补充协议与原协议的条款不得相互矛盾。若存在冲突，需明确约定“以补充协议为准”或通过条款解释规则（如时间优先、特定条款优先）解决冲突。
     
   • 补充协议可对原协议的未尽事宜进行补充，或对已约定事项进行变更（如修改付款方式、延长合作期限），但变更内容需双方明确同意。

3. 形式要件合规

   • 书面形式：根据《民法典》第469条，补充协议原则上需采用书面形式（纸质或电子合同均可），口头协议难以举证且易引发纠纷。
     
   • 签字/盖章：双方需在补充协议上签字（自然人）或盖章（法人/非法人组织），签字人需具有代理权（如法定代表人、授权代表）。若签字人无权代理，需事后追认否则协议不生效。
     
   • 日期明确：补充协议需注明签订日期，以确定其与原协议的时间关系（如是否覆盖原协议某条款的效力期间）。

4. 意思表示真实
   双方签订补充协议时需基于真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如：

   • 若一方以隐瞒关键信息（如合作项目已亏损）的方式诱使对方签订补充协议，受欺诈方可主张撤销协议；
     
   • 若一方因对方威胁（如“不签补充协议就终止合作并索赔”）而签订，可主张协议无效。

5. 不损害第三方利益
   补充协议的内容不得损害第三方合法权益（如原协议涉及第三方受益条款，补充协议擅自取消该条款可能无效）。若补充协议涉及第三方权利义务，需征得第三方同意（如债权转让需通知债务人）。

操作建议：

• 签订前核对原协议条款，确保补充协议内容无遗漏或冲突；
  
• 明确约定补充协议的生效条件（如“自双方签字盖章之日起生效”或“待某条件成就后生效”）；
  
• 保留协议签订过程的证据（如邮件往来、谈判记录），以备纠纷时证明双方真实意思。
  

若有具体条款设计或效力争议，可直接向我咨询，我会结合协议内容提供针对性方案。