未备案经营第二类医疗器械属于违法行为，将面临一系列严厉的行政处罚。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据
根据《中华人民共和国医疗器械监督管理条例》第八十四条的规定，经营第二类医疗器械应当备案但未备案的，由负责药品监督管理的部门向社会公告单位和产品名称，并责令限期改正。若逾期不改正，将面临没收违法所得、违法经营的医疗器械，以及相应的罚款。
二、主要行政处罚措施
责令限期改正与公告：
- 监管部门会向社会公告违法单位和产品名称，并责令其在规定期限内改正未备案行为。这是给予违法者一个改正的机会，以避免更严厉的处罚。
没收违法所得及医疗器械：
- 若在规定期限内未能改正，监管部门将依法没收所有违法所得以及违法经营的医疗器械。这是为了剥夺违法者的非法利益，并防止其继续违法经营。
罚款：
- 违法经营的医疗器械货值金额不足1万元的，并处1万元以上5万元以下罚款。例如，某小型企业经营的未备案医疗器械货值5000元，可能面临1万元至5万元罚款。
- 货值金额1万元以上的，并处货值金额5倍以上20倍以下罚款。如某企业违法经营的货值达5万元，则可能面临25万元至100万元罚款。罚款金额根据违法情节的严重程度、经营规模及违法所得等因素确定。
额外处罚：
- 对于情节严重的，对违法单位的法定代表人、主要负责人、直接负责的主管人员和其他责任人员，没收违法行为发生期间自本单位所获收入，并处所获收入30%以上2倍以下罚款，5年内禁止其从事医疗器械生产经营活动。这是为了对违法者进行更严厉的惩戒，并防止其再次违法。
三、经营者的权利与应对措施
陈述、申辩权：
- 面对行政处罚，经营者有权向监管部门陈述和申辩，说明情况并解释违法原因。监管部门应听取并采纳合理意见，确保处罚的公正性和合理性。
申请听证权：
- 对于较严重的行政处罚（如大额罚款、吊销经营资质等），经营者有权要求举行听证，以更充分地为自己辩护。听证程序有助于保障经营者的合法权益，确保处罚决定的合法性和合理性。
及时整改：
- 收到处罚通知后，经营者应立即按照监管部门的要求进行整改，完成备案手续并规范经营管理。这是避免更严厉处罚的关键步骤，也是经营者应尽的法律义务。
寻求法律帮助：
- 对行政处罚决定不服时，经营者可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。法律程序为经营者提供了救济途径，确保其合法权益不受侵害。
四、特别提示
- 在疫情防控期间，若生产或销售不符合标准的医用器材（如口罩、护目镜、防护服等），且足以严重危害人体健康的，还可能触犯刑法，构成生产、销售不符合标准的医用器材罪。因此，经营者在经营医疗器械时，必须严格遵守相关法规和标准，确保产品的质量和安全性。
- 医疗器械经营企业应严格遵守相关法规，确保经营活动的合法性和安全性。未备案经营第二类医疗器械不仅面临行政处罚，还可能对公众健康造成严重危害。因此，经营者应高度重视备案工作，确保合法经营。
综上所述，未备案经营第二类医疗器械将面临严厉的行政处罚。作为医疗器械经营企业，必须严格遵守相关法规，确保经营活动的合法性和安全性。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。