结论：房子登记在自己名下，但写了协议表明与自己无关，该房子是否会被执行，取决于协议的性质、内容以及执行的具体情况，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、协议性质与内容的影响
如果协议是有效的债权协议：
- 例如，你与他人签订了一份借款协议，并约定将房子作为借款的担保，但并未办理抵押登记。在这种情况下，虽然房子登记在你名下，但根据协议，你对房子并不享有真正的所有权，而是承担了还款义务。如果借款人（即你）未能按时还款，债权人（即出借人）虽然不能直接对房子进行执行（因为没有办理抵押登记，不享有优先受偿权），但可以通过法律途径要求你承担还款责任，并在你无力偿还时，申请法院执行你的其他财产（如果房子是你唯一的财产且未设定其他权利限制，理论上也可能涉及执行，但实践中会更为复杂）。不过，若协议中明确约定了房子的归属或处理方式，且该约定不违反法律强制性规定，那么在处理相关纠纷时，该约定将作为重要参考。
如果协议是有效的物权协议，且已办理相关登记或变更手续：
- 例如，你与他人签订了一份房屋买卖协议，并约定将房子过户给对方，但因某些原因（如贷款未还清、税费未缴纳等）尚未办理过户手续。在这种情况下，虽然房子仍然登记在你名下，但根据协议，你已经将房子的所有权转让给了对方。如果对方已经支付了购房款，并实际占有了房子，且协议内容合法有效，那么对方有权要求你继续履行过户义务。如果因你的原因导致房子被执行（如你因其他债务被法院查封房子），对方可以提出执行异议，主张自己对房子的所有权，并要求法院停止执行。
如果协议是无效的或存在瑕疵：
- 如果协议因违反法律强制性规定、欺诈、胁迫等原因而无效，或者协议内容存在模糊不清、歧义等瑕疵，那么该协议可能无法对房子的归属或处理方式产生决定性影响。在这种情况下，房子仍然登记在你名下，你作为名义上的所有权人，可能需要承担与房子相关的法律责任（如因房子产生的税费、维修费用等），且在特定情况下（如你因其他债务被法院查封房子），房子也可能被执行。
二、执行具体情况的影响
- 执行依据：房子是否会被执行，还取决于执行的具体依据。如果执行依据是针对你的债务，且房子是你名下的财产，那么在没有其他特殊情况（如上述协议有效且已办理相关手续）下，房子有可能被执行。
- 执行程序：在执行过程中，法院会综合考虑各种因素（如房子的实际归属、协议的有效性、你的还款能力等）来决定是否执行房子。如果存在有效的协议且该协议对房子的归属或处理方式有明确约定，法院可能会根据协议内容来处理执行事宜。
三、法律建议
- 完善协议内容：如果你与他人签订了关于房子的协议，建议确保协议内容合法有效、明确无误，并尽可能办理相关登记或变更手续（如过户、抵押登记等），以避免未来可能出现的纠纷。
- 保留相关证据：在签订协议和履行协议过程中，建议保留好相关证据（如协议文本、付款凭证、过户手续等），以便在需要时证明自己的权益。
- 及时咨询专业律师：如果你对协议的效力、房子的归属或处理方式存在疑问，或者面临房子被执行的风险，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体、更专业的法律建议。
总之，房子登记在自己名下但写了协议表明与自己无关，该房子是否会被执行取决于协议的性质、内容以及执行的具体情况。如果你面临类似问题，建议根据上述分析结合自己的实际情况进行判断，并及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。