结论前置：股份有限公司营业执照被法院查封6年未注销，可能面临1万元以上10万元以下的罚款，具体金额需根据实际情况和当地法规确定。此外，还可能面临吊销营业执照、列入经营异常名录或黑名单、以及强制执行等处罚。以下是对此问题的详细分析：
一、罚款规定
企业法人营业执照的罚款：
- 根据《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国市场主体登记管理条例》的相关规定，企业法人营业执照逾期不登记（包括未按规定注销）的，将处以1万元以上10万元以下的罚款。这一罚款范围适用于股份有限公司等企业法人类型，具体罚款金额取决于营业执照的类型及是否遵守了相关变更登记规定。
罚款金额的确定因素：
- 罚款金额的具体确定会综合考虑市场主体的类型、规模、违法情节等因素。例如，若股份有限公司在营业执照被查封期间仍继续经营或存在其他违法行为，可能面临更重的罚款。
二、其他处罚措施
吊销营业执照：
- 若股份有限公司开业后自行停业连续六个月以上，或存在其他严重违反法律法规的行为，登记机关有权吊销其营业执照。被吊销后若不办理注销，可能进一步面临罚款，且罚款数额各地规定不同，一般在数千元到数万元不等。
列入经营异常名录或黑名单：
- 营业执照长期未注销的股份有限公司，可能被列入经营异常名录或黑名单。这将严重影响其信用记录，对未来的经营活动产生不良影响，如限制参与政府采购、招投标等活动。
强制执行：
- 对于拒不履行注销义务的股份有限公司，工商行政管理部门有权依法申请人民法院强制执行。这可能导致公司财产被查封、扣押或拍卖等后果。
三、法律建议与行动指南
及时咨询与办理注销：
- 鉴于营业执照被查封6年未注销可能带来的严重法律后果，建议股份有限公司尽快咨询当地工商行政管理部门或专业律师，了解具体的注销流程和要求，并尽快办理注销手续。
配合调查与整改：
- 若公司因违法行为导致营业执照被查封，应积极配合相关部门的调查工作，并按照要求进行整改。这有助于减轻或避免进一步的法律处罚。
关注信用记录修复：
- 若公司已被列入经营异常名录或黑名单，应在办理注销手续后，积极关注信用记录的修复工作。通过履行相关义务、提交证明材料等方式，争取尽快恢复良好的信用记录。
综上所述，股份有限公司营业执照被法院查封6年未注销，可能面临严重的法律后果和经济损失。因此，强烈建议相关公司尽快采取行动，咨询当地工商行政管理部门并办理注销手续，以确保自身合法权益不受损害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。