针对您提出的“有继承公证书但法院判决后被告人还是不拿房本怎么办”的问题，这确实是一个涉及法律程序和执行的问题，下面我将为您详细解答：
首先，需要明确的是，继承公证书是公证机构根据当事人的申请，依照法律规定证明哪些人对被继承人的遗产享有继承权并证明其继承活动真实、合法的证明活动。然而，即使有了继承公证书，如果涉及诉讼且法院作出了判决，那么执行判决就成为了关键。
一、理解法院判决
判决内容：法院判决通常会明确房产的归属，即由哪位继承人继承房产。如果判决中明确指定了您为房产的继承人，那么您就有权要求被告人（即其他继承人或相关方）配合办理房产过户手续。
判决效力：法院判决具有法律效力，一旦判决生效，被告人就有义务履行判决内容。如果被告人不履行，您可以采取法律手段来强制执行。
二、执行判决
申请强制执行：如果被告人不配合办理房产过户手续，您可以向法院申请强制执行。法院会依法对被告人采取相应的强制措施，如查封、扣押、拍卖等，以迫使被告人履行判决。
执行程序：在申请强制执行时，您需要向法院提交相关证据材料，如继承公证书、法院判决书等。法院会审查这些材料，并依法作出执行裁定。然后，法院会指定执行人员负责执行，您需要配合执行人员的工作。
三、办理房产过户
准备材料：在执行过程中或执行完毕后，您需要准备相关材料来办理房产过户手续。这些材料通常包括继承公证书、法院判决书、身份证明、房产证等。
前往不动产登记中心：准备好材料后，您需要前往不动产登记中心办理房产过户手续。不动产登记中心会审查您的材料，并依法办理过户登记。
四、特殊情况处理
如果房产未取得权属证书：如果房产尚未取得不动产权属证书，但根据法院判决和实际情况可以确定其属于被继承人死亡时遗留的财产，那么您可以先办理房产使用权的继承手续（如分割使用权），待房产取得权属证书后再办理所有权过户手续。
如果被告人拒不配合且无法联系：如果被告人拒不配合且无法联系，您可以向法院申请公告送达执行通知书等法律文书。公告期满后，如果被告人仍未履行判决，法院可以依法采取强制措施。
五、建议
保持沟通：在执行过程中，尽量与被告人保持沟通，尝试通过协商解决问题。如果沟通无果，再考虑采取法律手段。
寻求专业帮助：如果您对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您更好地维护自己的权益。
综上所述，即使有了继承公证书和法院判决，如果被告人不配合办理房产过户手续，您仍然可以通过申请强制执行等法律手段来维护自己的权益。希望这些解答能对您有所帮助。