结论：司法所调解协议结束恋爱关系签过之后又在一起了，该协议本身并不因此自动失效，但其实际履行情况可能会受到影响，具体需根据协议内容、双方行为及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 协议的法律效力：

   • 司法所调解协议，若是在双方自愿、平等的基础上达成，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议在签署时即具有法律效力。
   • 协议的法律效力不因双方后续的行为（如又在一起）而自动丧失。除非双方明确约定协议的有效期或解除条件，且这些条件在后续行为中得以满足。

2. 协议的实际履行：

   • 尽管协议具有法律效力，但双方后续又在一起的行为可能会影响协议的实际履行。例如，如果协议中约定了双方需保持一定距离、不再干涉对方生活等条款，而双方又在一起显然违反了这些条款。
   • 在这种情况下，一方可以依据协议向另一方主张违约责任，但另一方可能会以双方实际行为改变了协议初衷为由进行抗辩。

3. 协议的变更或解除：

   • 如果双方希望改变协议的内容或解除协议，应当通过协商一致的方式达成新的协议或补充协议，并明确约定新的权利义务关系。
   • 在没有达成新协议或补充协议的情况下，原协议仍然有效，但双方的实际行为可能会构成对协议的默示变更或解除，这需要根据具体情况进行判断。

4. 法律建议：

   • 如果双方对协议的效力或履行存在争议，建议首先通过协商的方式解决。协商过程中，可以明确各自的权利义务，以及后续的行为准则。
   • 如果协商不成，可以考虑寻求法律途径解决。在诉讼或仲裁过程中，需要提供充分的证据证明自己的主张，包括协议文本、双方行为记录等。

可能的后果：

• 如果一方坚持要求按照原协议履行，而另一方拒绝履行，且没有合理的抗辩理由，那么拒绝履行的一方可能会承担违约责任，包括赔偿损失等。
• 如果双方的行为已经构成了对协议的默示变更或解除，且没有达成新的协议或补充协议，那么双方可能需要根据实际情况重新确定各自的权利义务关系。

进一步思考：

• 在处理此类问题时，除了考虑协议的法律效力外，还需要考虑双方的感情因素、实际行为对协议履行的影响以及社会伦理道德等因素。
• 如果双方希望继续保持某种关系（如恋爱关系），但又不希望受到原协议的约束，那么最好通过协商的方式达成新的协议或补充协议，以明确双方的权利义务关系。

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