公寓楼顶在周六周末进行维修施工是否合法，这主要取决于施工是否遵守了相关的噪音管理规定以及是否获得了必要的许可。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
噪音管理规定：
- 根据《中华人民共和国环境噪声污染防治法》的相关规定，法定休息日、节假日全天及工作日12时至14时、18时至次日8时，禁止在已竣工交付使用的住宅楼内进行产生噪声的装修作业。虽然该条款主要针对的是装修作业，但维修施工若产生类似噪音，同样可能受到此规定的约束。
- 如果维修施工产生的噪音超过了当地规定的标准，那么即使在周六周末进行施工也可能是不合法的。因此，施工方需要确保施工活动不会对周围居民的正常生活造成干扰。
施工许可与通知：
- 在进行公寓楼顶的维修施工前，物业或施工方通常需要获得相关部门的许可，并提前通知业主或住户。这是为了确保施工活动的合法性和透明度，同时让业主或住户有机会提出异议或安排其他事宜。
- 如果施工方未获得必要许可或未提前通知业主/住户，那么即使施工活动本身不产生噪音，也可能因违反程序规定而被视为不合法。
特殊情况与例外：
- 在某些特殊情况下，如紧急维修或抢修工程，可能需要在非工作时间进行施工。这种情况下，施工方通常需要获得相关部门的特别许可，并采取必要的措施来减少对周围居民的影响。
- 如果施工活动符合当地政府的特殊规定或政策（如鼓励夜间施工以减少交通拥堵等），那么也可能在周六周末进行合法施工。
法律建议：
- 如果您作为公寓的业主或住户，对周六周末的楼顶维修施工有异议，首先可以尝试与物业或施工方进行沟通，了解施工的具体情况、目的和预计持续时间。
- 如果沟通无果或您认为施工活动违反了相关法律法规，您可以向当地的环保部门、城管部门或相关管理部门进行投诉或举报。
- 在处理此类纠纷时，保留相关证据（如噪音测量记录、施工通知、沟通记录等）将有助于您维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果施工方未遵守相关法律法规进行施工，可能会面临罚款、停工整顿等行政处罚。
- 作为业主或住户，如果因施工活动受到噪音干扰或其他损失，您有权要求施工方承担相应的民事责任，包括赔偿损失等。
综上所述，公寓楼顶在周六周末进行维修施工是否合法取决于多种因素。如果您对此有疑问或担忧，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。