在车主和司机不是同一人，且车主不提供证件的情况下，是否会进行赔偿，这主要取决于事故责任划分、保险情况以及车主与司机之间的法律关系，以下分情况讨论：
保险赔偿情况：
- 交强险赔偿：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。这意味着，如果车辆购买了交强险，无论车主是否提供证件，保险公司都应在保险限额内承担赔偿责任。
- 商业三者险赔偿：超出交强险赔偿限额的部分，如果车辆购买了商业三者险，保险公司也应根据保险合同进行赔付。同样，车主不提供证件并不影响保险公司的赔偿责任，但可能会影响理赔流程的顺利进行，因为保险公司可能需要车主的证件来核实保险信息。
车主与司机之间的法律关系：
- 雇佣关系：如果司机是车主雇佣的，且事故发生在雇佣活动期间，那么根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，车主作为雇主可能需要承担赔偿责任。这种情况下，车主不提供证件可能会影响赔偿责任的认定，但并非决定性因素。
- 借用或租赁关系：如果司机是借用或租赁车主的车辆，且事故是由于司机的过错造成的，那么司机应承担赔偿责任。车主不提供证件可能不会影响司机赔偿责任的承担，但车主可能因未尽到管理义务而承担一定的连带责任。
- 无偿帮工关系：如果司机是无偿为车主提供帮工，且事故发生在帮工活动期间，那么根据相关规定，车主可能需要承担赔偿责任。车主不提供证件同样可能影响赔偿责任的认定，但并非绝对。
事故责任划分：
- 无论车主是否提供证件，事故责任的划分都是基于事故发生的实际情况和双方的过错程度。如果司机被认定为全责或主要责任，那么司机（或车主，根据上述法律关系）应承担相应的赔偿责任。
车主不提供证件的可能后果：
- 车主不提供证件可能会影响理赔流程的顺利进行，因为保险公司可能需要这些证件来核实保险信息、确定赔偿范围等。
- 在某些情况下，车主不提供证件可能会被视为不配合理赔工作，从而影响其获得赔偿的权利。但这并非绝对，具体还需根据保险公司的规定和实际情况来判断。
建议：
- 在处理此类事故时，应尽快与保险公司联系，了解理赔流程和所需材料，并积极配合提供相关信息。
- 如果车主不提供证件导致理赔受阻，可以尝试通过法律途径解决，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
- 在日常用车过程中，车主应妥善保管好自己的证件和保险单等重要文件，以便在需要时能够及时提供。
总结来说，车主不提供证件并不直接影响赔偿责任的承担，但可能会影响理赔流程的顺利进行。在处理此类事故时，应综合考虑保险情况、车主与司机之间的法律关系以及事故责任划分等因素来确定赔偿责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。