办理涉及伪造国家机关证件的刑事案件立案，主要由公安机关负责。以下是对这一问题的详细分析：

一、立案部门

在涉及伪造国家机关证件的刑事案件中，立案工作主要由公安机关承担。公安机关作为国家的治安保卫机关，负责刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕和预审等工作。当发现有伪造国家机关证件的犯罪行为时，公安机关会依法进行立案侦查，收集证据，查明犯罪事实，并依法对犯罪嫌疑人采取强制措施。

二、立案条件

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在决定是否立案时，会考虑以下因素：

1. 犯罪事实的存在：即是否有证据表明存在伪造国家机关证件的犯罪行为。
2. 需要追究刑事责任：即犯罪嫌疑人的行为是否构成犯罪，且是否需要依法追究其刑事责任。

只有同时满足上述两个条件，公安机关才会依法立案侦查。

三、立案后的程序

一旦公安机关决定立案，将会按照以下程序进行：

1. 侦查：公安机关会依法对案件进行侦查，收集证据，查明犯罪事实，并依法对犯罪嫌疑人采取强制措施。
2. 审查起诉：侦查终结后，公安机关会将案件移送人民检察院审查起诉。人民检察院会对案件进行审查，决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。
3. 审判：如果人民检察院决定提起公诉，案件将会进入审判阶段。人民法院会依法对案件进行审理，并作出判决。

四、法律后果

伪造国家机关证件是一种严重的犯罪行为，一旦构成犯罪，将会受到法律的严厉制裁。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章的，将会被处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，将会被处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

五、建议

如果您或您身边的人涉嫌伪造国家机关证件，我建议您：

1. 立即停止违法行为：如果尚未实施或正在实施伪造行为，应立即停止，以避免更严重的法律后果。
2. 主动配合调查：如果已经被公安机关立案侦查，应主动配合调查，如实陈述事实，提供证据，以争取从轻或减轻处罚。
3. 寻求法律帮助：在整个过程中，您可以随时向我咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。

如果您有任何关于股权转让、刑事辩护等领域的法律问题，也可以直接向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律服务。