交换土地写了协议，并非必须双方一起去备案，但备案能更好地保障双方权益，具体分析如下：

1. 备案并非强制要求：

   • 根据现行法律法规，土地交换协议本身并不强制要求双方必须共同去相关部门备案。协议的效力主要取决于其是否符合法律规定的合同成立要件，如双方意思表示真实、内容合法、不违反公序良俗等。

2. 备案的积极作用：

   • 增强公示公信力：备案可以将土地交换的事实向社会公开，有助于防止一方在协议签订后擅自处分土地，从而保护另一方的合法权益。
   • 便于后续管理：备案后的协议在土地管理部门有记录，便于后续的土地管理、规划、征收等工作，减少因土地权属不清而引发的纠纷。
   • 作为证据使用：在发生争议时，备案的协议可以作为证明双方土地交换事实的重要证据，有助于快速解决纠纷。

3. 备案的具体流程：

   • 如果双方决定备案，应携带土地交换协议、身份证明、土地权属证明等相关材料，共同前往当地土地管理部门或相关机构进行备案登记。
   • 备案过程中，工作人员会对协议内容进行审核，确保其符合法律法规要求，并办理相应的备案手续。

4. 不备案的风险：

   • 虽然不备案不影响协议的效力，但可能增加后续纠纷的风险。例如，一方可能擅自处分土地，导致另一方权益受损；或者在土地征收、规划等工作中，因权属不清而引发争议。

建议：为了更好地保障双方权益，减少后续纠纷，建议在签订土地交换协议后，双方共同前往相关部门进行备案登记。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。