起诉离婚后仍住在一起的情况确实比较复杂，需要从情感、法律以及子女权益等多个方面来综合考虑和处理。以下是一些具体的建议和指导：
一、情感与生活安排
明确身份与界限：
- 双方应坦诚沟通，确认已经解除婚姻关系，并作为独立个体共处。
- 制定共同生活规则，如家务分担、公共空间使用等，以减少矛盾和冲突。
考虑适时分居：
- 如果经济和条件允许，建议分开居住，以促进双方的情感独立。
- 如果暂时无法分居，应设定分居计划，并为之努力，比如寻找新的住处或协商居住安排。
二、法律层面处理
财产分割与债务管理：
- 遵循离婚协议或法院判决执行财产分割，保持财产的独立性。
- 对于共同生活期间产生的新债务，需要明确性质和责任，最好通过书面协议来约定。
- 如果离婚时未分割共同财产且双方同意暂不分割，应了解相关法律规定，如一年内任何一方反悔，可向法院提起诉讼要求分割。
居住权与居住安排：
- 双方应就居住问题达成共识，包括居住期限、规则等，以确保双方权益。
- 可以考虑通过书面形式订立居住权合同，明确居住权人的权利与义务。
法律关系变化：
- 离婚后，双方不再具有夫妻间的扶养义务和继承权，需要适应这一法律地位的变化。
- 如果发生矛盾或纠纷，可以通过人民调解委员会调解或向法院提起诉讼解决。
签订书面协议：
- 强烈建议双方签订详细的书面协议，涵盖居住安排、财产分配、生活费分摊等各个方面，以预防未来可能出现的争议。
三、子女权益保障
统一教育理念：
- 父母应保持一致的教育观念，避免在子女面前发生冲突，以保护其身心健康。
明确抚养责任：
- 根据离婚协议或法院判决，明确抚养费的支付、探视权的行使等，确保子女成长环境的稳定与健康。
四、特别注意事项
法律程序期间的居住权：
- 起诉离婚仅代表一方向法院提起了解除婚姻关系的诉讼，在法院作出离婚判决且判决生效前，夫妻关系在法律上依然有效。因此，这段时间内双方共同居住并不违反法律规定。
- 但一旦法院判决离婚且判决生效，若无特殊协议，继续共同居住可能会涉及同居关系的认定及相关权利义务的处理，可能产生新的法律问题。
安全考虑：
- 在决定是否继续共同居住时，应首要考虑自己的安全和舒适感。如果感到不安全或受到威胁，应立即寻求法律帮助。
综上所述，起诉离婚后仍住在一起需要双方以成熟、理性的态度面对，并通过法律手段和生活智慧的结合来妥善处理各种问题。希望这些建议能对你有所帮助。