农村有养殖证的也不可以在基本农田建鱼塘。以下从多个角度为你详细分析：

法律规定层面

根据我国《土地管理法》及《基本农田保护条例》的相关规定，国家实行永久基本农田保护制度，基本农田的用途被严格限定为粮食和棉、油、糖、蔬菜等农产品及饲料、工业原料的生产。挖鱼塘属于改变土地用途的行为，它破坏了耕地的耕作层，降低了土地的耕种条件，直接影响了粮食生产能力。因此，《基本农田保护条例》明确规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内挖鱼塘、建窑、建房、建坟、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。这一规定并未因持有养殖证而有所例外，所以即便有养殖证，也不能在基本农田上建鱼塘。

特殊情况与审批层面

虽然存在一些特殊情况，即因农业结构调整确实需要适当发展水产养殖的，但必须依法依规经过相关部门的严格审批，并严格按照规定的程序和要求进行操作。在确保不破坏基本农田耕作层且能够恢复为耕地的前提下，才有可能被允许开展一定规模的相关活动。然而，这种情况相对较少，且审批管理极为严格，并非持有养殖证就能轻易获得审批。

法律后果层面

如果违反规定，在基本农田上擅自挖鱼塘，将会面临严重的法律后果。这包括责令改正、罚款等行政处罚，甚至可能因构成犯罪而需要承担刑事责任。这些法律后果的设定，旨在保护基本农田这一重要的国家资源，确保国家粮食安全和重要农产品的有效供给。

综上所述，无论是否持有养殖证，都不可以在基本农田上建鱼塘。如有关于土地使用或农业方面的疑问，或者需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。