在经济纠纷案件中，如果双方同意调解，是否收取受理费用需分情况讨论：

1. 调解发生在诉讼前（诉前调解）
   若双方在正式立案前通过法院特邀调解组织或调解员达成调解协议，并申请司法确认或出具调解书，法院通常不收取诉讼费。但若调解失败转入诉讼程序，则需按标准缴纳诉讼费。

2. 调解发生在诉讼中（庭审调解）
   若案件已立案，法院在审理过程中组织调解并成功，诉讼费会按比例减免。根据《诉讼费用交纳办法》第十五条，以调解方式结案的，减半交纳案件受理费。例如，原需缴纳1万元诉讼费，调解后仅需支付5000元。

3. 特殊情形说明

   • 若调解协议涉及财产分割、赔偿等需法院出具法律文书的，可能需缴纳少量工本费（如调解书制作费），但远低于诉讼费标准。
     
   • 若调解后一方反悔未履行，另一方申请强制执行时，执行阶段不另行收取执行费（执行费已包含在原诉讼费中或由被执行人承担）。

建议：

• 调解前可主动向法院立案庭或调解组织确认费用政策，避免误解；
  
• 若担心费用问题，可在调解协议中明确约定“诉讼费由哪方承担”或“双方各承担一半”，以减少后续争议。
  

如有具体案件细节需进一步分析，欢迎随时向我咨询。