股东大会在符合法定程序和公司章程规定的情况下，可以更换公司法定代表人。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国公司法》第十三条的规定，公司法定代表人由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。这表明，公司法定代表人的确定及变更均需依据法律和公司章程进行，且必须办理相应的变更登记手续。
二、更换法定代表人的程序
召集股东大会：
- 更换法定代表人属于公司重大事项，需召开股东大会进行表决。在股份有限公司中，单独或合计持有公司百分之十以上股份的股东请求时，应在两个月内召开临时股东大会。
形成有效决议：
- 股东大会需作出变更法定代表人的决议，且该决议必须经法定比例的股东通过。在股份有限公司中，通常需经出席会议的股东所持表决权过半数通过。若公司章程有特别规定（如三分之二以上表决权），则需满足该规定。
办理变更登记：
- 公司应自作出变更法定代表人决议之日起30日内，向原公司登记机关申请变更登记。提交的材料包括变更登记申请书、股东大会决议、新任法定代表人的身份证明等。经公司登记机关核准后，完成法定代表人的变更。
三、特殊情况与限制
公司章程的特殊规定：
- 若公司章程对法定代表人的更换设置了更严格的条件或程序（如全体股东一致同意），则需按章程执行。这意味着，即使股东大会通过了更换法定代表人的决议，但如果该决议违反了公司章程的规定，也可能无法得到公司登记机关的核准。
原法定代表人的合法权益：
- 若法定代表人的任命基于有效合同或协议，且更换可能导致违约等法律责任，股东在更换时需考虑这些因素，并可能承担相应法律后果。例如，如果原法定代表人与公司签订了服务合同，且合同中规定了服务期限和违约责任，那么在更换法定代表人时，公司可能需要与原法定代表人协商解除合同或承担违约责任。
原法定代表人不配合的情况：
- 若原法定代表人不配合变更，公司可通过有效的股东大会决议撤销其职务，并依据此决议及其他相关材料办理变更登记。在这种情况下，公司可能需要采取法律手段来强制原法定代表人履行配合义务，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
四、建议与总结
严格遵守法律法规和公司章程：
- 在更换法定代表人的过程中，公司必须严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保变更行为的合法性和有效性。否则，可能会面临法律风险和行政处罚。
充分保护公司和股东的利益：
- 更换法定代表人可能涉及公司的重大利益调整，因此应充分考虑公司和股东的利益，避免损害任何一方权益。在决策过程中，应充分听取各方意见，确保决策的公正性和合理性。
及时通知相关方并办理相关手续：
- 变更完成后，公司应及时通知与公司有业务往来的合作伙伴、债权人等相关方，以确保业务的连续性和稳定性。同时，公司还需办理税务登记、银行账户信息变更等其他相关手续，以确保公司的正常运营。
如果您在更换法定代表人过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。