非法占地上的建筑物不能折旧。以下从不同角度为你详细分析：

法律层面

1. 非法占地建筑物的性质：非法占地上的建筑物，是指未经合法审批程序，在非法占用的土地上建造的建筑物。这种建筑物本身违反了土地管理相关法律法规，属于违法建筑。根据《中华人民共和国土地管理法》等相关规定，对于非法占地行为，相关部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施。这表明非法占地上的建筑物从法律定性上是不被认可的，其存在本身就处于一种违法状态。
2. 折旧的概念及适用范围：折旧通常是指在固定资产的使用过程中，由于损耗而逐渐转移到成本或费用中的那部分价值。在法律和财务领域，能够进行折旧的资产一般是合法取得、合法使用的固定资产。而非法占地上的建筑物由于缺乏合法的土地使用手续和建设审批手续，不属于合法固定资产的范畴，因此不适用折旧的相关规定。

实际处理层面

1. 行政处理：当发现非法占地上的建筑物时，行政机关会依法进行查处。在查处过程中，主要关注的是如何消除违法状态，恢复土地的合法使用，而不是考虑建筑物的折旧问题。例如，行政机关会责令违法当事人拆除建筑物，退还非法占用的土地，并可能处以罚款等行政处罚。在这个过程中，建筑物的价值不会因为其存在时间的长短而得到认可，更不会按照折旧的方式进行计算。
2. 司法处理：在涉及非法占地建筑物的司法案件中，如因非法占地引发的行政诉讼或民事纠纷等，法院在审理案件时也不会将建筑物的折旧纳入考虑范围。法院主要审查的是行政行为的合法性、当事人的违法行为以及相应的法律责任等问题。对于非法占地上的建筑物，法院通常会支持行政机关的查处决定，要求违法当事人承担相应的法律责任，而不会对建筑物的折旧进行认定和计算。

特殊情况说明

如果非法占地上的建筑物在后续经过合法的补办手续，转变为合法建筑，那么在这种情况下，该建筑物就有可能按照相关规定进行折旧。但这种情况需要满足一系列严格的条件，包括补办土地使用手续、建设审批手续等，并且要经过相关部门的验收和认可。不过，这种情况相对较为少见，且补办手续的过程也非常复杂和严格。

综上所述，非法占地上的建筑物由于其违法性质，不能进行折旧。如果你有关于农村土地或宅基地方面的其他法律问题，可以直接向我咨询。