关于保安公司上班每天12小时是否算超时费（即加班费）的问题，这主要取决于具体的工时制度以及用人单位的工作安排。以下是对此问题的详细解答：

一、标准工时制下的情况

在标准工时制下，根据《中华人民共和国劳动法》的规定，劳动者每日工作时间不应超过8小时，平均每周工作时间不应超过44小时（也有说法为40小时，具体以最新法律法规为准）。如果保安每天工作12小时，那么超出的4小时部分，通常应被认定为加班时间。

加班费支付标准：

• 延长工作时间（即加点）的，用人单位应支付不低于工资的150%的工资报酬。
• 如果这超出的4小时是在休息日（如周六、周日）且未安排补休的，则应支付不低于工资的200%的工资报酬。
• 如果是在法定休假日（如春节、国庆等）工作的，则应支付不低于工资的300%的工资报酬。

二、特殊工时制下的情况

如果保安岗位经过劳动行政部门批准，实行了不定时工作制或综合计算工时工作制，那么情况就会有所不同。

1. 不定时工作制：

   • 在这种制度下，保安的工作时间不固定，可能因工作需要而延长或缩短。
   • 但用人单位仍需确保保安的休息休假权利，并在法定节假日安排工作时支付加班工资。

2. 综合计算工时工作制：

   • 这种制度是以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的。
   • 如果在一个计算周期内，保安的总工作时间超过了法定标准工作时间，那么超出的部分应视为加班，并依法支付加班工资。

三、用人单位的责任与劳动者的权益

无论采用何种工时制度，用人单位都有责任确保保安的合法权益得到保障，包括合理的工作时间和加班报酬。如果用人单位未按规定支付加班工资，或者未经劳动者同意擅自延长工作时间，那么保安有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

四、总结与建议

综上所述，保安每天上班12小时是否算超时费（加班费），主要取决于具体的工时制度和用人单位的工作安排。在大多数情况下，如果采用标准工时制且未支付加班费，那么这种做法是违法的。如果保安认为自己的权益受到了侵害，建议与用人单位进行协商；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。