单位内部往来款没有合同，仍然存在诉讼时效的问题。以下从多个角度为你详细分析：
诉讼时效的基本概念
诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权，可以拒绝履行其债务的法律制度。这一制度旨在督促权利人及时行使权利，维护交易秩序和安全。
没有合同是否影响诉讼时效的适用
合同并非诉讼时效适用的必要条件：诉讼时效的适用并不完全依赖于合同的存在。即使没有书面合同，只要双方之间存在事实上的债权债务关系，且该关系受到法律保护，那么诉讼时效就可能适用。在单位内部往来款的情况下，即使没有签订书面合同，但如果双方之间存在明确的资金往来记录、转账凭证、对账单等证据，能够证明双方之间存在债权债务关系，那么诉讼时效就可能开始计算。
诉讼时效的起算点：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在单位内部往来款的情况下，如果一方未按照约定或习惯履行还款义务，且另一方知道或应当知道这一事实，那么诉讼时效就可能从此时开始计算。
诉讼时效的具体应用
普通诉讼时效期间：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。在单位内部往来款的情况下，如果双方之间存在债权债务关系，且该关系受到法律保护，那么权利人应在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内行使权利，否则可能丧失胜诉权。
最长诉讼时效期间：除了普通诉讼时效期间外，还存在最长诉讼时效期间。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。这一规定为权利人提供了更长的保护期限，但同样要求权利人在知道或应当知道权利受到损害后及时行使权利。
实际操作建议
保留证据：在单位内部往来款的情况下，即使没有书面合同，也应尽量保留转账凭证、对账单、聊天记录等证据，以证明双方之间存在债权债务关系。
及时行使权利：一旦发现对方未按照约定或习惯履行还款义务，应及时与对方沟通协商，并考虑通过法律途径维护自己的权益。避免因超过诉讼时效期间而丧失胜诉权。
咨询专业律师：在处理复杂的债权债务关系时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况为你提供更详细的法律建议和操作方案。
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