针对您提出的“付多运费不给退回起诉需要什么手续”的问题，以下是我为您整理的详细解答流程，以确保您的合法权益得到有效维护：
一、收集充分证据
合同原件：首先，您需要找到与运输公司签订的合同原件，这是证明双方权利义务关系的基础。合同中应明确约定退费条款，包括退费的具体条件、方式和时间等。
违约证据：收集运输公司违约的相关证据，如双方的沟通记录（邮件、短信、微信聊天记录等），其中运输公司承认违约或有相关违约表述；以及运输服务未按约定完成的相关单据、货物状态记录等。
支付凭证：保存好向运输公司支付费用的凭证，如转账记录、发票等，以证明您已履行支付义务，且支付金额超出了应支付的运费。
二、确定管辖法院
根据《民事诉讼法》的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
被告住所地：即运输公司注册登记的地址。若其实际经营地与注册地不一致，您需要提供相关证据证明实际经营地，并以实际经营地为住所地。
合同履行地：根据合同的具体履行情况来确定。若合同中有明确约定，则按约定执行；若没有约定或约定不明确，则根据争议标的的性质来确定。在您的情况下，若争议关于退费问题，您作为接收货币一方，您的住所地可能被视为合同履行地。
三、撰写并提交起诉状
起诉状内容：起诉状应明确记载原告和被告的基本信息、诉讼请求（要求运输公司退还多付的运费及可能的赔偿）、事实与理由（详细叙述运输合同的签订、履行情况及运输公司违约的事实）以及列出所有能支持诉求的证据和证据来源。
提交起诉材料：将起诉状按照被告人数提出副本，并附上收集好的证据材料。前往有管辖权的法院立案庭提交起诉材料，并按照法院要求进行编号、整理，制作证据清单。
四、等待法院受理与审理
立案审查：法院收到起诉材料后，会进行审查。若材料齐全、符合起诉条件，法院会在七日内立案，并通知您缴纳诉讼费。诉讼费的金额根据您起诉的标的金额按比例计算。
庭前准备：法院立案后，会安排开庭时间并送达开庭传票等法律文书。在开庭前，您需要进一步熟悉案件事实和证据，预测对方可能提出的抗辩理由，并准备好相应的回应。如有需要，可以咨询专业律师获取法律意见。
五、参加庭审
出庭陈述：按照传票上注明的时间、地点准时参加庭审。在庭审过程中，如实回答法官的询问，展示证据，并参与法庭辩论。清晰、准确地阐述自己的观点和理由，反驳对方的不合理主张。
调解与判决：若双方愿意，可以在法庭主持下进行调解。若调解不成，法院将根据审理情况作出判决。一般会在规定的审限内下达判决书。
六、等待判决与执行
宣判与上诉：庭审结束后，法院会进行宣判。若对判决结果不服，您可以在判决书送达之日起十五日内向上一级人民法院提起上诉。
申请执行：若运输公司在判决书规定的履行期限内未主动退还多付的运费，您可以在期限届满后向法院申请强制执行。申请时需提交强制执行申请书、生效判决书等材料。法院将依法采取多种执行措施，如查询、冻结、划拨运输公司的银行存款，查封、扣押、拍卖其财产等，以实现您的权益。
在整个起诉过程中，我建议您保持耐心和冷静，积极配合法院的工作，并随时准备应对可能出现的复杂情况。同时，咨询专业律师的意见可以确保您的权益得到充分保障。希望这些解答能对您有所帮助。