贷款逾期被法院起诉后还清贷款，法院一般会根据实际情况对案件作出撤诉或终结诉讼的处理。具体分析如下：

1. 若在法院正式受理前还清贷款：

   • 银行或贷款机构在发现借款人已还清逾期贷款后，通常会主动向法院申请撤回起诉。此时，法院会审查撤诉申请，若符合法律规定（如撤诉是原告真实意思表示、不损害国家和社会公共利益等），法院会裁定准许撤诉，案件就此终结，借款人无需再承担后续诉讼程序带来的负担。

2. 若在法院正式受理后还清贷款：

   • 撤诉情况：若在法院开庭前或审理过程中，借款人还清贷款，银行或贷款机构仍可申请撤诉，法院审查后若认为撤诉理由正当，会裁定准许撤诉，案件终结。
   • 终结诉讼情况：若案件已进入审理阶段，且银行或贷款机构不同意撤诉，或法院认为撤诉可能损害其他当事人合法权益（如存在其他共同被告、案件涉及公共利益等），则法院可能不会准许撤诉。但借款人已还清贷款的事实会成为法院裁判的重要依据，法院在查明事实后，会依法判决驳回银行或贷款机构的诉讼请求（即判决借款人无需再承担还款责任），从而终结诉讼。

建议：

• 借款人还清贷款后，应及时与银行或贷款机构沟通，确认其是否已向法院申请撤诉，并保留好还款凭证等相关证据。
• 若银行或贷款机构未申请撤诉，或法院未准许撤诉，借款人应积极应诉，向法院提交还款凭证等证据，证明自己已履行还款义务，以维护自身合法权益。

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